Cell cycle genes are the evolutionarily conserved targets of the E2F4 transcription factor.
Cell cycle genes are the evolutionarily conserved targets of the E2F4 transcription factor.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0001061
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发表时间：
2007-10-24
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Odom, Duncan T.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Conboy, Caitlin M.;Spyrou, Christiana;Thorne, Natalie P.;Wade, Elizabeth J.;Barbosa-Morais, Nuno L.;Wilson, Michael D.;Bhattacharjee, Arindam;Young, Richard A.;Tavare, Simon;Lees, Jacqueline A.;Odom, Duncan T.
细胞在G0期的静止状态的维持部分是通过一种被称为DREAM的多蛋白亚基复合物实现的，在人类细胞系中，转录因子E2F4引导该复合物作用于其细胞周期靶点。我们发现，E2F4在三种不同的原代组织和一种非同步细胞系中结合一组高度重叠的人类基因，这表明组织特异性结合伴侣和染色质结构对E2F4的靶向作用影响极小。为了研究这些转录因子结合事件的保守性，我们确定了在七种原代小鼠组织和一种细胞系中E2f4所结合的小鼠基因。E2f4结合了一组在小鼠组织中常见的小鼠基因，但与在人类中结合的基因有很大差异。E2F4结合的基因中进化上保守的那一组在对维持细胞静止状态具有重要作用的功能相关调控相互作用方面高度富集。相比之下，我们发现E2f4基因敲除小鼠的肝脏、肾脏和睾丸中，这一核心的E2f4结合基因集的mRNA表达扰动极小。因此，即使保守的转录因子结合事件完全缺失，维持静止状态的调控机制也是很稳健的。
Maintaining quiescent cells in G0 phase is achieved in part through the multiprotein subunit complex known as DREAM, and in human cell lines the transcription factor E2F4 directs this complex to its cell cycle targets. We found that E2F4 binds a highly overlapping set of human genes among three diverse primary tissues and an asynchronous cell line, which suggests that tissue-specific binding partners and chromatin structure have minimal influence on E2F4 targeting. To investigate the conservation of these transcription factor binding events, we identified the mouse genes bound by E2f4 in seven primary mouse tissues and a cell line. E2f4 bound a set of mouse genes that was common among mouse tissues, but largely distinct from the genes bound in human. The evolutionarily conserved set of E2F4 bound genes is highly enriched for functionally relevant regulatory interactions important for maintaining cellular quiescence. In contrast, we found minimal mRNA expression perturbations in this core set of E2f4 bound genes in the liver, kidney, and testes of E2f4 null mice. Thus, the regulatory mechanisms maintaining quiescence are robust even to complete loss of conserved transcription factor binding events.
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影响因子：
20.3
作者：
Kinross, Kathryn M.;Clark, Allison J.;Humbert, Patrick Orson
通讯作者：
Humbert, Patrick Orson
DOI：
10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x
发表时间：
1995-01-01
影响因子：
5.8
作者：
BENJAMINI, Y;HOCHBERG, Y
通讯作者：
HOCHBERG, Y
影响因子：
5.8
作者：
MacIsaac, KD;Gordon, DB;Fraenkel, E
通讯作者：
Fraenkel, E
影响因子：
3.3
作者：
Ceol, Craig J.;Stegmeier, Frank;Horvitz, H. Robert
通讯作者：
Horvitz, H. Robert
影响因子：
10.5
作者：
Frolov, MV;Huen, DS;Dyson, NJ
通讯作者：
Dyson, NJ