The Trypanosoma brucei spliced leader RNA and rRNA gene promoters have interchangeable TbSNAP50-binding elements.
The Trypanosoma brucei spliced leader RNA and rRNA gene promoters have interchangeable TbSNAP50-binding elements.
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布氏锥虫剪接前导 RNA 和 rRNA 基因启动子具有可互换的 TbSNAP50 结合元件。
DOI：
10.1093/nar/gkh231
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发表时间：
2004
影响因子：
14.9
通讯作者：
A. Günzl
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bernd Schimanski;Gabriel Laufer;L. Gontcharova;A. Günzl
在原生寄生虫布氏锥虫中，小核剪接前导 (SL) RNA 和大 rRNA 分别是 mRNA 成熟和蛋白质合成的关键分子。 SL RNA 基因 (SLRNA) 启动子招募 RNA 聚合酶 II，由二部分上游序列元件 (USE) 和靠近转录起始位点的元件组成。在这里，我们分析了核糖体 (RRNA) 启动子的远端部分，并鉴定了两个序列块，它们的方向相反，在序列和间距方面都与 SLRNA USE 非常相似。详细的突变分析表明，核糖体 (r)USE 对于体内有效的 RRNA 转录至关重要，并且它以方向依赖的方式发挥作用。此外，我们表明 USE 和 rUSE 在功能上是可以互换的，并且 rUSE 与 SLRNA 转录的必需因子稳定地相互作用。最后，我们证明了最近鉴定的相关生物体 Leptomonas seymouri 的转录因子 p57 的 T.brucei 同源物与 USE 和 rUSE 特异性结合。由于 p57 及其 T.brucei 对应物与 SNAP50（人类小核 RNA 基因激活蛋白复合物 (SNAPc) 的一个组成部分）同源，因此 T.brucei 中的 SLRNA 和 RRNA 转录可能依赖于 SNAPc 样转录因子。
In the protist parasite Trypanosoma brucei, the small nuclear spliced leader (SL) RNA and the large rRNAs are key molecules for mRNA maturation and protein synthesis, respectively. The SL RNA gene (SLRNA) promoter recruits RNA polymerase II and consists of a bipartite upstream sequence element (USE) and an element close to the transcription initiation site. Here, we analyzed the distal part of the ribosomal (RRNA) promoter and identified two sequence blocks which, in reverse orientation, closely resemble the SLRNA USE by both sequence and spacing. A detailed mutational analysis revealed that the ribosomal (r)USE is essential for efficient RRNA transcription in vivo and that it functions in an orientation-dependent manner. Moreover, we showed that USE and rUSE are functionally interchangeable and that rUSE stably interacted with an essential factor of SLRNA transcription. Finally, we demonstrated that the T.brucei homolog of the recently characterized transcription factor p57 of the related organism Leptomonas seymouri specifically bound to USE and rUSE. Since p57 and its T.brucei counterpart are homologous to SNAP50, a component of the human small nuclear RNA gene activation protein complex (SNAPc), both SLRNA and RRNA transcription in T.brucei may depend on a SNAPc-like transcription factor.
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布氏锥虫 parp 基因启动子的解剖。
DOI：
10.1002/j.1460-2075.1991.tb04902.x
发表时间：
1991
期刊：
The EMBO journal
影响因子：
--
作者：
Sherman,DR;Janz,L;Hug,M;Clayton,C
通讯作者：
Clayton,C
利什曼原虫剪接前导 RNA 基因的启动子活性和蛋白质结合的单核苷酸分辨率。
影响因子：
1.5
作者：
Yu,MC;Sturm,NR;Saito,RM;Roberts,TG;Campbell,DA
通讯作者：
Campbell,DA
影响因子：
10.5
作者：
HENDERSON, SL;RYAN, K;SOLLNERWEBB, B
通讯作者：
SOLLNERWEBB, B
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影响因子：
1.5
作者：
Huie,JL;He,P;Bellofatto,V
通讯作者：
Bellofatto,V
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通讯作者：
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