Systematic classification of vertebrate chemokines based on conserved synteny and evolutionary history.
Systematic classification of vertebrate chemokines based on conserved synteny and evolutionary history.
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DOI：
10.1111/gtc.12013
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发表时间：
2013-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Yoshie O
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Nomiyama H;Osada N;Yoshie O
已知参与宿主防御的基因会经历快速进化。因此，通常很难在各种脊椎动物物种的多基因家族中分配直系同源物。趋化因子是一大类小细胞因子，可协调健康和疾病中的细胞迁移。在此，我们对18种代表性脊椎动物的基因组进行了趋化因子基因的调查，共鉴定出553个基因。我们确定了它们的直系同源关系，并根据当前系统的趋化因子命名系统对它们进行了分类。我们的研究揭示了一段有趣的进化历史，它赋予了脊椎动物趋化因子超家族的起源和多样化。
The genes involved in host defences are known to undergo rapid evolution. Therefore, it is often difficult to assign orthologs in multigene families among various vertebrate species. Chemokines are a large family of small cytokines that orchestrate cell migration in health and disease. Herein, we have surveyed the genomes of 18 representative vertebrate species for chemokine genes and identified a total of 553 genes. We have determined their orthologous relationships and classified them in accordance with the current systematic chemokine nomenclature system. Our study reveals an interesting evolutionary history that gave origin and diversification to the vertebrate chemokine superfamily.
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DOI：
10.1073/pnas.252339399
发表时间：
2002-12-10
影响因子：
11.1
作者：
David, NB;Sapède, D;Ghysen, A
通讯作者：
Ghysen, A
影响因子：
11.4
作者：
Hoegg, S;Meyer, A
通讯作者：
Meyer, A
影响因子：
64.8
作者：
Kasahara, Masahiro;Naruse, Kiyoshi;Kohara, Yuji
通讯作者：
Kohara, Yuji
影响因子：
64.8
作者：
Delsuc, F;Brinkmann, H;Philippe, H
通讯作者：
Philippe, H
影响因子：
4.8
作者：
Luttichau, Hans R.;Johnsen, Anders H.;Schwartz, Thue W.
通讯作者：
Schwartz, Thue W.