hichipper: a preprocessing pipeline for calling DNA loops from HiChIP data.
hichipper: a preprocessing pipeline for calling DNA loops from HiChIP data.
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DOI：
10.1038/nmeth.4583
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发表时间：
2018-02-28
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Aryee, Martin J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lareau, Caleb A.;Aryee, Martin J.
此外，hichipper还生成了一份QC报告，该报告允许对文库制备进行评估，包括诸如邻位连接和染色质免疫沉淀的效率等因素。我们提供了成功和不成功的HiChIP实验的QC报告示例，以指导新用户评估自己的库质量。
Methods).Additionally, hichipper produces a QC report that allows evaluation of library preparation, including factors such as the efficiency of proximity ligation and chromatin immunoprecipitation. We provide example QC reports from both successful and unsuccessful HiChIP experiments to guide new users in assessing their own library quality.
影响因子：
12.3
作者：
Servant N;Varoquaux N;Lajoie BR;Viara E;Chen CJ;Vert JP;Heard E;Dekker J;Barillot E
通讯作者：
Barillot E
影响因子：
48
作者：
Mumbach, Maxwell R.;Rubin, Adam J.;Chang, Howard Y.
通讯作者：
Chang, Howard Y.