Peptidomic discovery of short open reading frame-encoded peptides in human cells.
Peptidomic discovery of short open reading frame-encoded peptides in human cells.
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DOI：
10.1038/nchembio.1120
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发表时间：
2013-01
影响因子：
14.8
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
翻译成多肽的转录组的量是至关重要的。我们开发了一种检测人类细胞中短ORF（sORF）编码多肽（SEP）的肽组策略。我们确定了90个SEP，其中86个是新的，是有史以来报道的人类SEP数量最多的。SEP丰度范围为每个细胞10-1000个分子，与已知蛋白质相同。SEP来自非编码RNA以及多顺反子mRNA中的sORF，并且许多SEP以非AUG起始密码子起始，表明非规范翻译在哺乳动物中可能比以前认为的更普遍。此外，编码sORF存在于一小部分（8/1866）的长基因间非编码RNA（lincRNA）中。总之，这些结果提供了迄今为止最有力的证据，证明人类蛋白质组比以前认识到的更复杂。
The amount of the transcriptome that is translated into polypeptides is of fundamental importance. We developed a peptidomic strategy to detect short ORF (sORF)-encoded polypeptides (SEPs) in human cells. We identified 90 SEPs, 86 of which are novel, the largest number of human SEPs ever reported. SEP abundances range from 10-1000 molecules per cell, identical to known proteins. SEPs arise from sORFs in non-coding RNAs as well as multi-cistronic mRNAs, and many SEPs initiate with non-AUG start codons, indicating that non-canonical translation may be more widespread in mammals than previously thought. In addition, coding sORFs are present in a small fraction (8/1866) of long intergenic non-coding RNAs (lincRNAs). Together, these results provide the strongest evidence to date that the human proteome is more complex than previously appreciated.
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