The complete mitochondrial genome of the leafhopper Idiocerus herrichii (Hemiptera: Cicadellidae: Idiocerinae)
The complete mitochondrial genome of the leafhopper Idiocerus herrichii (Hemiptera: Cicadellidae: Idiocerinae)
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叶蝉 Idiocerus herrichii 的完整线粒体基因组（半翅目：蝉科：Idiocerinae）
DOI：
10.1080/23802359.2020.1742212
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发表时间：
2020-03
影响因子：
0.5
通讯作者：
Zhang Bin
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shan Liang-chen-yu;Di Xiao-chen;Luo Huan;Zhang Bin
摘要：我们通过新一代测序确定了叶蝉 Idiocerus herrichii 的完整线粒体基因组（线粒体基因组）。与昆虫典型的线粒体DNA相似，线粒体基因组大小为15,489bp，A + T含量为78.4%，包含13个蛋白质编码基因（PCG）、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码区。大多数 PCG 均以典型的 ATN 密码子起始，但 ATP8 和 ND5 除外，它们以 TTG 起始。除COX2、ND5、ND4和ND1具有不完整终止密码子T外，大多数PCG均以典型的TAA密码子终止。连接的PCG与GenBank中20个叶蝉的线粒体基因组数据一起进行贝叶斯系统发育分析。
Abstract We determined the complete mitochondrial genome (mitogenome) of the leafhopper Idiocerus herrichii by next-generation sequencing. Similar to the typical mtDNA of insects, the mitogenome is 15,489 bp in size, with an A + T content of 78.4%, comprises 13 protein-coding genes (PCGs), two rRNA genes, 22 tRNA genes, and one non-coding region. Most of the PCGs are initiated with the typical ATN codon, with exception to ATP8 and ND5, which are started with TTG. Most PCGs are terminated with the typical TAA codon, except for COX2, ND5, ND4 and ND1 with the incomplete termination codon T. The concatenated PCGs were used to conduct Bayesian phylogenetic analyses together with 20 mitogenome data of leafhoppers in GenBank.
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DOI：
10.1016/j.ijbiomac.2018.08.191
发表时间：
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