Design and implementation of a low cost, modular, adaptable and open-source XYZ positioning system for neurophysiology.
Design and implementation of a low cost, modular, adaptable and open-source XYZ positioning system for neurophysiology.
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DOI：
10.1016/j.ohx.2020.e00098
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发表时间：
2020-04
期刊：
影响因子：
2.2
通讯作者：
Jones, James F. X.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Campbell, Thomas;Jones, James F. X.
关键词：
近年来，开源3D打印技术越来越多地应用于生物研究。我们使用3D打印机组件创建了一个完全开源、多功能和低成本的XYZ定位系统。由于该系统由运行在Raspberry Pi 3 Model B上的基于Python 3的操作系统控制，因此其行为可以适应神经生理学的多种需求。我们已经开发了这个系统的两个主要应用程序。首先，我们创建了一个自动化的显微镜脚本，它与ImageJ（斐济）中的图像拼接插件无缝链接，允许用户创建高分辨率的蒙太奇。第二，我们已经创建了一系列的运动脚本，允许对肌梭应用分级的拉伸速率。在这里，我们概述了这个系统的建设和实施，并讨论我们如何利用这个工具在我们的研究。
In recent years, open-source 3D printing technologies have become increasingly applied to biological research. We have created a fully open-source, versatile and low cost XYZ positioning system using 3D printer components. As this system is controlled by a Python3 based operating system running on a Raspberry Pi 3 Model B, its behaviour can be adapted to meet multiple needs in neurophysiology. We have developed two main applications of this system. First, we have created an automated microscopy script that links seamlessly with image stitching plugins in ImageJ (Fiji) allowing the user to create high resolution montages. Second, we have created a series of movement scripts allowing the application of graded rates of stretch to muscle spindles. Here we outline the construction and implementation of this system and discuss how we have utilised this tool in our research.
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影响因子：
3.7
作者：
Campbell RA;Eifert RW;Turner GC
通讯作者：
Turner GC
影响因子：
9.2
作者：
Carvalho G;Balestrino D;Forestier C;Mathias JD
通讯作者：
Mathias JD
影响因子：
9.8
作者：
Baden T;Chagas AM;Gage GJ;Marzullo TC;Prieto-Godino LL;Euler T
通讯作者：
Euler T
平铺 3D 显微图像采集的全局最佳拼接。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp184
发表时间：
2009-06-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Preibisch S;Saalfeld S;Tomancak P
通讯作者：
Tomancak P
影响因子：
2.2
作者：
Agcayazi, Talha;Foster, Marc;Bozkurt, Alper
通讯作者：
Bozkurt, Alper