A genome-wide association scan (GWAS) for mean telomere length within the COGS project: identified loci show little association with hormone-related cancer risk.
A genome-wide association scan (GWAS) for mean telomere length within the COGS project: identified loci show little association with hormone-related cancer risk.
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COGS 项目中对平均端粒长度进行的全基因组关联扫描 (GWAS)：确定的基因座与激素相关癌症风险几乎没有关联。
DOI：
10.1093/hmg/ddt355
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发表时间：
2013-12-15
影响因子：
3.5
通讯作者：
Nordestgaard BG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Pooley KA;Bojesen SE;Weischer M;Nielsen SF;Thompson D;Amin Al Olama A;Michailidou K;Tyrer JP;Benlloch S;Brown J;Audley T;Luben R;Khaw KT;Neal DE;Hamdy FC;Donovan JL;Kote-Jarai Z;Baynes C;Shah M;Bolla MK;Wang Q;Dennis J;Dicks E;Yang R;Rudolph A;Schildkraut J;Chang-Claude J;Burwinkel B;Chenevix-Trench G;Pharoah PD;Berchuck A;Eeles RA;Easton DF;Dunning AM;Nordestgaard BG
血细胞的平均端粒长度（TL）是遗传的，据报道与包括癌症在内的几种疾病的风险有关。我们对TL的三个GWAS（总n=2240）进行了荟萃分析，并通过“iCOGS”定制基因分型阵列选择了1629个变异进行复制。用TL分析了所有~ 200000个iCOGS变异，并在乳腺癌病例（n = 11024）中进一步检测了健康对照（n = 15065）中显示相关的iCOGS变异。我们发现在3p14.4位点与PXK位点存在新的TL关联（Ptrend < 4 × 10−10），并且在6p22.1位点（ZNF311）和20q11.2位点（BCL2L1）存在TL关联（Ptrend < 7 × 10−7）。我们进一步证实了先前报道的3q26.2 （TERC）、5p15.3 （TERT）和10q24.3 （OBFC1）位点（Ptrend < 5 × 10−14），并发现了已发表的2p16.2 （ACYP2）、4q32.2 （NAF1）和20q13.3 （RTEL1）位点的支持证据（Ptrend < 5 × 10−4）。标记这些位点的snp解释了高达731 bp的TL差异（相当于健康个体总TL的18%），然而，它们几乎没有显示与乳腺癌、卵巢癌或前列腺癌风险相关的直接证据。
Mean telomere length (TL) in blood cells is heritable and has been reported to be associated with risks of several diseases, including cancer. We conducted a meta-analysis of three GWAS for TL (total n=2240) and selected 1629 variants for replication via the “iCOGS” custom genotyping array. All ∼200 000 iCOGS variants were analysed with TL, and those displaying associations in healthy controls (n = 15 065) were further tested in breast cancer cases (n = 11 024). We found a novel TL association (Ptrend < 4 × 10−10) at 3p14.4 close to PXK and evidence (Ptrend < 7 × 10−7) for TL loci at 6p22.1 (ZNF311) and 20q11.2 (BCL2L1). We additionally confirmed (Ptrend < 5 × 10−14) the previously reported loci at 3q26.2 (TERC), 5p15.3 (TERT) and 10q24.3 (OBFC1) and found supportive evidence (Ptrend < 5 × 10−4) for the published loci at 2p16.2 (ACYP2), 4q32.2 (NAF1) and 20q13.3 (RTEL1). SNPs tagging these loci explain TL differences of up to 731 bp (corresponding to 18% of total TL in healthy individuals), however, they display little direct evidence for association with breast, ovarian or prostate cancer risks.
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来自1,092个人基因组的遗传变异的综合图。
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
14.9
作者：
Cawthon RM
通讯作者：
Cawthon RM
DOI：
10.1016/0921-8734(91)90018-7
发表时间：
1991-03-01
期刊：
MUTATION RESEARCH
影响因子：
--
作者：
HARLEY, CB
通讯作者：
HARLEY, CB
影响因子：
10.3
作者：
Benn, Marianne;Tybjaerg-Hansen, Anne;Nordestgaard, Borge G.
通讯作者：
Nordestgaard, Borge G.
DOI：
10.1073/pnas.0702703104
发表时间：
2007-07-17
影响因子：
11.1
作者：
Njajou, Omer T.;Cawthon, Richard M.;Hsueh, Wen-Chi
通讯作者：
Hsueh, Wen-Chi