A rapid and efficient method of genotyping zebrafish mutants.
A rapid and efficient method of genotyping zebrafish mutants.
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DOI：
10.1002/dvdy.22143
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发表时间：
2009-12
影响因子：
2.5
通讯作者：
Yost, H. Joseph
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Parant, John M.;George, Stephen A.;Pryor, Rob;Wittwer, Carl T.;Yost, H. Joseph
为了促进斑马鱼高通量基因分型，我们开发了一种新的技术，使用高分辨率熔化分析（HRMA）来区分野生型，杂合突变体和纯合突变体。这项一小时的技术不需要限制性内切酶和琼脂玫瑰凝胶。生成的熔化曲线轮廓足够灵敏，可以检测非特异性PCR产物。我们已经能够可靠地对斑马鱼的三种突变进行基因分型，包括点突变，apchu745 (apcmcr), p53zy7 (p53I166T)，小缺失突变（bap28y75）和逆转录病毒插入突变（wdr43hi821a）。这项技术可以对个体斑马鱼胚胎和成年（通过尾巴夹）进行基因分型，并适用于其他模式生物。
In order to facilitate high throughput genotyping of zebrafish, we have developed a novel technique that uses High Resolution Melting Analysis (HRMA) to distinguish wild-type, heterozygous mutants and homogyzous mutants. This one hour technique removes the need for restriction enzymes and aga-rose gels. The generated melting curve profiles are sensitive enough to detect non-specific PCR products. We have been able to reliably genotype three classes of mutations in zebrafish, including point mutants, apchu745 (apcmcr), and p53zy7 (p53I166T), a small deletion mutant (bap28y75) and a retroviral insertion mutant (wdr43hi821a). This technique can genotype individual zebrafish embryos and adults (by tail-clip) and is applicable to other model organisms.
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影响因子：
9.3
作者：
Cheng, Ju-Chien;Huang, Chien-Ling;Tseng, Ching-Ping
通讯作者：
Tseng, Ching-Ping
影响因子：
7
作者：
Till, BJ;Reynolds, SH;Henikoff, S
通讯作者：
Henikoff, S
影响因子：
9.3
作者：
Herrmann, Mark G.;Durtschi, Jacob D.;Voelkerding, Karl V.
通讯作者：
Voelkerding, Karl V.
影响因子：
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作者：
Neff, MM;Neff, JD;Pepper, AE
通讯作者：
Pepper, AE
影响因子：
9.3
作者：
Herrmann, MG;Durtschi, JD;Voelkerding, KV
通讯作者：
Voelkerding, KV