Defining the Functional Targets of Cap'n'collar Transcription Factors NRF1, NRF2, and NRF3.
Defining the Functional Targets of Cap'n'collar Transcription Factors NRF1, NRF2, and NRF3.
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定义Cap'n'Collar转录因子NRF1，NRF2和NRF3的功能靶标。
DOI：
10.3390/antiox9101025
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发表时间：
2020-10-21
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Bollong MJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ibrahim L;Mesgarzadeh J;Xu I;Powers ET;Wiseman RL;Bollong MJ
NRF转录因子NRF1、NRF2和NRF3是Cap 'n 'collar转录调控因子的一个子集，它们调节基因组位点内含有抗氧化反应元件（are）序列的基因的表达。尽管NRF家族成员在生理上的重要性逐渐显现，但它们的遗传靶点仍未完全确定。在这里，我们使用基于rna测序的转录谱分析和定量蛋白质组学来描述受三种NRF转录因子影响的重叠和差异遗传程序。然后，我们创建了由NRF1、NRF2和NRF3调控的目标基因集，并定义了这些基因集的完整性，以探测哺乳动物细胞培养和人体组织中NRF的活性。总之，我们的数据提供了NRF家族成员如何塑造蛋白质组和转录组的定量评估，为理解NRF转录因子的关键生理重要性提供了框架，并为在疾病中治疗性地激活这些转录程序建立了药理学方法。
The NRF transcription factors NRF1, NRF2, and NRF3, are a subset of Cap‘n’collar transcriptional regulators which modulate the expression of genes harboring antioxidant-response element (ARE) sequences within their genomic loci. Despite the emerging physiological importance of NRF family members, the repertoire of their genetic targets remains incompletely defined. Here we use RNA-sequencing-based transcriptional profiling and quantitative proteomics to delineate the overlapping and differential genetic programs effected by the three NRF transcription factors. We then create consensus target gene sets regulated by NRF1, NRF2, and NRF3 and define the integrity of these gene sets for probing NRF activity in mammalian cell culture and human tissues. Together, our data provide a quantitative assessment of how NRF family members sculpt proteomes and transcriptomes, providing a framework to understand the critical physiological importance of NRF transcription factors and to establish pharmacologic approaches for therapeutically activating these transcriptional programs in disease.
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