Single-cell RNA-seq highlights intratumoral heterogeneity in primary glioblastoma.
Single-cell RNA-seq highlights intratumoral heterogeneity in primary glioblastoma.
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DOI：
10.1126/science.1254257
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发表时间：
2014-06-20
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Bernstein BE
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Patel AP;Tirosh I;Trombetta JJ;Shalek AK;Gillespie SM;Wakimoto H;Cahill DP;Nahed BV;Curry WT;Martuza RL;Louis DN;Rozenblatt-Rosen O;Suvà ML;Regev A;Bernstein BE
人类癌症是由具有不同表型、基因型和表观遗传状态的细胞组成的复杂生态系统，但目前的模型不能充分反映患者的肿瘤组成。我们使用单细胞RNA-seq分析了来自5个原发性胶质母细胞瘤的430个细胞，我们发现这些细胞在与致癌信号传导、增殖、补体/免疫反应和缺氧相关的多种转录程序的表达中具有固有的可变性。我们还观察到一个连续的干相关的表达状态，使我们能够确定假定的调节剂的干在体内。最后，我们表明，已建立的胶质母细胞瘤亚型分类器在肿瘤内的单个细胞中表达，并证明了这种肿瘤内异质性的潜在预后意义。因此，我们揭示了以前未被重视的异质性，在不同的监管程序中央胶质母细胞瘤的生物学，预后和治疗。
Human cancers are complex ecosystems composed of cells with distinct phenotypes, genotypes and epigenetic states, but current models do not adequately reflect tumor composition in patients. We used single cell RNA-seq to profile 430 cells from five primary glioblastomas, which we found to be inherently variable in their expression of diverse transcriptional programs related to oncogenic signaling, proliferation, complement/immune response and hypoxia. We also observed a continuum of stemness-related expression states that enabled us to identify putative regulators of stemness in vivo. Finally, we show that established glioblastoma subtype classifiers are variably expressed across individual cells within a tumor and demonstrate the potential prognostic implications of such intratumoral heterogeneity. Thus, we reveal previously unappreciated heterogeneity in diverse regulatory programs central to glioblastoma biology, prognosis, and therapy.
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影响因子：
46.9
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
64.5
作者：
Roesch A;Fukunaga-Kalabis M;Schmidt EC;Zabierowski SE;Brafford PA;Vultur A;Basu D;Gimotty P;Vogt T;Herlyn M
通讯作者：
Herlyn M
影响因子：
82.9
作者：
Eppert, Kolja;Takenaka, Katsuto;Dick, John E.
通讯作者：
Dick, John E.
影响因子：
64.8
作者：
Navin N;Kendall J;Troge J;Andrews P;Rodgers L;McIndoo J;Cook K;Stepansky A;Levy D;Esposito D;Muthuswamy L;Krasnitz A;McCombie WR;Hicks J;Wigler M
通讯作者：
Wigler M
DOI：
10.1073/pnas.1219817110
发表时间：
2013-01-02
影响因子：
11.1
作者：
Choi, Bryan D.;Kuan, Chien-Tsun;Sampson, John H.
通讯作者：
Sampson, John H.