Class-specific restrictions define primase interactions with DNA template and replicative helicase.
Class-specific restrictions define primase interactions with DNA template and replicative helicase.
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DOI：
10.1093/nar/gkq588
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发表时间：
2010-11
影响因子：
14.9
通讯作者：
Hinrichs SH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Larson MA;Griep MA;Bressani R;Chintakayala K;Soultanas P;Hinrichs SH
细菌引物酶受复制解旋酶刺激产生DNA复制所必需的RNA引物。为了确定调节引发酶活性的机制，我们表征了引发酶起始特异性和与革兰氏阳性厚壁菌门（葡萄球菌、芽孢杆菌和土芽孢杆菌）和革兰氏阴性变形菌门（埃希氏菌、耶尔森氏菌和假单胞菌）的复制解旋酶的相互作用。引物酶锌结合结构域，RNA聚合酶结构域和解旋酶结合结构域从头引物合成的贡献，确定使用突变，截短，嵌合和野生型引物。引发酶锌结合结构域的β4链中的关键残基定义了类别相关的三核苷酸识别，并且这些氨基酸的取代跨类别转移特异性。模板识别的变化提供了功能的证据之间的相互作用的反式锌结合结构域和RNA聚合酶结构域的两个单独的引物。解旋酶与引物酶C-末端解旋酶结合结构域的结合以物种特异性方式调节RNA引物长度，并且产生的相互作用与遗传相关性无关。结果表明，引物酶模板特异性是保守的细菌类，而引物酶解旋酶相互作用已共同进化的每个物种。
Bacterial primase is stimulated by replicative helicase to produce RNA primers that are essential for DNA replication. To identify mechanisms regulating primase activity, we characterized primase initiation specificity and interactions with the replicative helicase for gram-positive Firmicutes (Staphylococcus, Bacillus and Geobacillus) and gram-negative Proteobacteria (Escherichia, Yersinia and Pseudomonas). Contributions of the primase zinc-binding domain, RNA polymerase domain and helicase-binding domain on de novo primer synthesis were determined using mutated, truncated, chimeric and wild-type primases. Key residues in the β4 strand of the primase zinc-binding domain defined class-associated trinucleotide recognition and substitution of these amino acids transferred specificity across classes. A change in template recognition provided functional evidence for interaction in trans between the zinc-binding domain and RNA polymerase domain of two separate primases. Helicase binding to the primase C-terminal helicase-binding domain modulated RNA primer length in a species-specific manner and productive interactions paralleled genetic relatedness. Results demonstrated that primase template specificity is conserved within a bacterial class, whereas the primase–helicase interaction has co-evolved within each species.
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影响因子：
2.9
作者：
Biswas, EE;Biswas, SB
通讯作者：
Biswas, SB
影响因子：
5.7
作者：
Pan, H;Wigley, DB
通讯作者：
Wigley, DB
影响因子：
3.6
作者：
Koepsell, Scott A.;Larson, Marilynn A.;Griep, Mark A.
通讯作者：
Griep, Mark A.
DOI：
10.1016/s0167-4781(99)00024-x
发表时间：
1999-03-19
期刊：
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENE STRUCTURE AND EXPRESSION
影响因子：
--
作者：
Bird, LE;Wigley, DB
通讯作者：
Wigley, DB
影响因子：
3.2
作者：
GROMPE, M;VERSALOVIC, J;LUPSKI, JR
通讯作者：
LUPSKI, JR