De Novo Discovery of High-Affinity Peptide Binders for the SARS-CoV-2 Spike Protein.
De Novo Discovery of High-Affinity Peptide Binders for the SARS-CoV-2 Spike Protein.
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DOI：
10.1021/acscentsci.0c01309
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发表时间：
2021-01-27
影响因子：
18.2
通讯作者：
Pentelute BL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Pomplun S;Jbara M;Quartararo AJ;Zhang G;Brown JS;Lee YC;Ye X;Hanna S;Pentelute BL
β-冠状病毒SARS-CoV-2已引起全球大流行。靶向SARS-CoV-2刺突蛋白的亲和试剂对于治疗和诊断的开发是有意义的。我们使用亲和选择质谱快速发现合成的高亲和力肽结合剂的受体结合域（RBD）的SARS-CoV-2刺突蛋白。从8亿个合成肽的文库筛选中，我们鉴定了三个对RBD具有纳摩尔亲和力（解离常数Kd = 80 - 970 nM）并且对人血清蛋白具有选择性的序列。生物基质中的纳摩尔RBD浓度可以使用ELISA形式的生物素化的前导肽来检测。这些肽不竞争ACE2结合，并且它们在SARS-CoV-2-spike-RBD上的相互作用位点可能与ACE2结合位点无关，使它们成为夹心免疫测定的潜在正交试剂。这些发现作为开发SARS-CoV-2诊断剂或用于病毒定向递送治疗剂的缀合物的起点。使用亲和力选择-质谱法，我们发现了对SARS-CoV-2-spike-RBD具有纳摩尔亲和力且对人类蛋白质具有选择性的合成肽。
The β-coronavirus SARS-CoV-2 has caused a global pandemic. Affinity reagents targeting the SARS-CoV-2 spike protein are of interest for the development of therapeutics and diagnostics. We used affinity selection–mass spectrometry for the rapid discovery of synthetic high-affinity peptide binders for the receptor binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 spike protein. From library screening with 800 million synthetic peptides, we identified three sequences with nanomolar affinities (dissociation constants Kd = 80–970 nM) for RBD and selectivity over human serum proteins. Nanomolar RBD concentrations in a biological matrix could be detected using the biotinylated lead peptide in ELISA format. These peptides do not compete for ACE2 binding, and their site of interaction on the SARS-CoV-2-spike-RBD might be unrelated to the ACE2 binding site, making them potential orthogonal reagents for sandwich immunoassays. These findings serve as a starting point for the development of SARS-CoV-2 diagnostics or conjugates for virus-directed delivery of therapeutics. Using affinity selection−mass spectrometry, we discovered synthetic peptides with nanomolar affinity for the SARS-CoV-2-spike-RBD and selectivity over human proteins.
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影响因子：
82.9
作者：
Long, Quan-Xin;Liu, Bai-Zhong;Huang, Ai-Long
通讯作者：
Huang, Ai-Long
影响因子：
2.4
作者：
Hurwitz, Amy M.;Huang, Wanzhi;Palzkill, Timothy
通讯作者：
Palzkill, Timothy
影响因子：
8.4
作者：
Amzat, Jimoh;Aminu, Kafayat;Danjibo, Maryann C.
通讯作者：
Danjibo, Maryann C.
DOI：
10.1126/science.abc0870
发表时间：
2020-09-04
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Chan KK;Dorosky D;Sharma P;Abbasi SA;Dye JM;Kranz DM;Herbert AS;Procko E
通讯作者：
Procko E
影响因子：
16.6
作者：
GeurtsvanKessel, Corine H.;Okba, Nisreen M. A.;Koopmans, Marion
通讯作者：
Koopmans, Marion