Toxicogenomics: A 2020 Vision.
Toxicogenomics: A 2020 Vision.
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DOI：
10.1016/j.tips.2018.12.001
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发表时间：
2019-02
影响因子：
13.8
通讯作者：
Tong, Weida
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Liu, Zhichao;Huang, Ruili;Roberts, Ruth;Tong, Weida
毒理基因组学（TGx）对毒理学做出了重大贡献，现在有很大的潜力支持在监管决策中采取无动物方法。在这里，我们讨论了体外TGx系统及其对风险评估的潜在影响。我们提高了对基因组学技术快速发展的认识，这些技术产生了对加强风险评估至关重要的新基因组学特征。我们特别强调在监管环境中使用TGx时可重复性的重要性。我们还强调了机器学习（特别是深度学习）在开发基于TGx的预测模型中的作用。最后，我们触及的主题TGx方法如何促进不良结果途径（AOP）的发展，并加强跨读策略，以进一步监管应用。最后，我们总结了目前的努力，开发TGx的风险评估，并提出了剩余的挑战。
Toxicogenomics (TGx) has contributed significantly to toxicology and now has great potential to support moves towards animal-free approaches in regulatory decision making. Here, we discuss in vitro TGx systems and their potential impact on risk assessment. We raise awareness of the rapid advancement of genomics technologies which generates novel genomics features essential for enhanced risk assessment. We specifically emphasize the importance of reproducibility in utilizing TGx in the regulatory setting. We also highlight the role of machine learning (particularly deep learning) in developing TGx-based predictive models. Lastly, we touch on the topics of how TGx approaches could facilitate adverse outcome pathways (AOP) development and enhance read-across strategies to further regulatory application. Finally, we summarize current efforts to develop TGx for risk assessment and set out remaining challenges.
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影响因子：
7.4
作者：
Attene-Ramos, Matias S.;Miller, Nicole;Huang, Ruili;Michael, Sam;Itkin, Misha;Kavlock, Robert J.;Austin, Christopher P.;Shinn, Paul;Simeonov, Anton;Tice, Raymond R.;Xia, Menghang
通讯作者：
Xia, Menghang
影响因子：
3.2
作者：
Krivoshiev, Boris V.;Beemster, Gerrit T. S.;Husson, Steven J.
通讯作者：
Husson, Steven J.
影响因子：
5.8
作者：
Chen, Yifei;Li, Yi;Xie, Xiaohui
通讯作者：
Xie, Xiaohui
DOI：
10.1109/tasl.2011.2134090
发表时间：
2012-01-01
影响因子：
--
作者：
Dahl, George E.;Yu, Dong;Acero, Alex
通讯作者：
Acero, Alex
Quaking 通过调节心脏循环 RNA 表达来抑制多柔比星介导的心脏毒性。
影响因子：
20.1
作者：
Gupta SK;Garg A;Bär C;Chatterjee S;Foinquinos A;Milting H;Streckfuß-Bömeke K;Fiedler J;Thum T
通讯作者：
Thum T