Combinatorial tetramer staining and mass cytometry analysis facilitate T-cell epitope mapping and characterization.
Combinatorial tetramer staining and mass cytometry analysis facilitate T-cell epitope mapping and characterization.
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DOI：
10.1038/nbt.2593
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发表时间：
2013-07
影响因子：
46.9
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
目前还不可能预测不同个体的T细胞会识别哪些表位。这是彻底分析和理解接种疫苗或感染后t细胞反应的障碍。在这里，通过结合大量细胞术和组合肽- mhc四聚体染色，我们开发了一种方法，可以快速和同时识别和表征许多表位特异性的T细胞。我们使用它在单个人类血液样本中筛选多达109种不同的肽- mhc四聚体，同时仍然保留至少23个标记来分析t细胞表型和功能的其他标记。在77个轮状病毒候选表位中，我们在健康人血液中鉴定出6个限制于人白细胞抗原(HLA)-A*0201的t细胞表位。轮状病毒VP3蛋白表位特异性T细胞表现出独特的表型，并在肠上皮中高频存在。这种方法对于t细胞对传染病或疫苗的反应的综合分析应该是有用的。
It is currently not possible to predict which epitopes will be recognized by T cells in different individuals. This is a barrier to the thorough analysis and understanding of T-cell responses after vaccination or infection. Here, by combining mass cytometry with combinatorial peptide–MHC tetramer staining, we have developed a method allowing the rapid and simultaneous identification and characterization of T cells specific for many epitopes. We use this to screen up to 109 different peptide–MHC tetramers in a single human blood sample, while still retaining at least 23 labels to analyze other markers of T-cell phenotype and function. Among 77 candidate rotavirus epitopes, we identified six T-cell epitopes restricted to human leukocyte antigen (HLA)-A*0201 in the blood of healthy individuals. T cells specific for epitopes in the rotavirus VP3 protein displayed a distinct phenotype and were present at high frequencies in intestinal epithelium. This approach should be useful for the comprehensive analysis of T-cell responses to infectious diseases or vaccines.
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影响因子：
48
作者：
Newell, Evan W.;Klein, Lawrence O.;Yu, Wong;Davis, Mark M.
通讯作者：
Davis, Mark M.
影响因子：
2.5
作者：
Gorfu G;Rivera-Nieves J;Ley K
通讯作者：
Ley K
DOI：
10.1126/science.1198704
发表时间：
2011-05-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Bendall SC;Simonds EF;Qiu P;Amir el-AD;Krutzik PO;Finck R;Bruggner RV;Melamed R;Trejo A;Ornatsky OI;Balderas RS;Plevritis SK;Sachs K;Pe'er D;Tanner SD;Nolan GP
通讯作者：
Nolan GP
影响因子：
32.4
作者：
Moon, James J.;Chu, H. Hamlet;Jenkins, Marc K.
通讯作者：
Jenkins, Marc K.
影响因子：
56.9
作者：
Altman, JD;Moss, PAH;Davis, MM
通讯作者：
Davis, MM