Control of mRNA splicing by noncoding intragenic RNA elements that evoke a cellular stress response.
Control of mRNA splicing by noncoding intragenic RNA elements that evoke a cellular stress response.
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通过引发细胞应激反应的非编码基因内 RNA 元件控制 mRNA 剪接
DOI：
10.1016/j.biocel.2018.09.021
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发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Kaempfer
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Kaempfer
一旦被双螺旋RNA激活，哺乳动物RNA依赖性应激蛋白激酶（PKR）就会磷酸化其底物翻译起始因子eIF 2 α，从而抑制翻译。eIF 2 α磷酸化对于启动细胞应激反应至关重要。我们描述了细胞基因内短的100-200个核苷酸元件，一旦转录，形成RNA结构，在RNA附近有效地激活PKR，从而严格地调控基因表达顺式。PKR的基因内RNA激活剂可以（a）通过激活PKR并诱导eIF 2 α磷酸化（例如IFN-γ基因）来减弱编码mRNA的翻译，或（B）通过激活PKR并诱导核eIF 2 α磷酸化来大大增强mRNA剪接效率，从而实现有效的早期剪接体组装，以成体和胎儿珠蛋白基因以及通过从鱼到人保守的RNA假结激活PKR的TNF-α基因为例。这些相反的结果大大扩展了这些新RNA元件的基因调控的潜在范围。
Once activated by double-helical RNA, mammalian RNA-dependent stress protein kinase, PKR, phosphorylates its substrate, translation initiation factor eIF2α, to inhibit translation. eIF2α phosphorylation is critical for mounting a cellular stress response. We describe short, 100–200 nucleotide elements within cellular genes that, once transcribed, form RNA structures that potently activate PKR in the vicinity of the RNA and thereby tightly regulate gene expression in cis. Intragenic RNA activators of PKR can (a) attenuate translation of the encoded mRNA by activating PKR and inducing eIF2α phosphorylation, exemplified by the IFN-γ gene, or (b) greatly enhance mRNA splicing efficiency by activating PKR and inducing nuclear eIF2α phosphorylation, thus enabling efficient early spliceosome assembly, exemplified by the adult and fetal globin genes and the TNF-α gene that activates PKR through an RNA pseudoknot conserved from fish to humans. These opposite outcomes considerably extend the potential scope of gene regulation by these novel RNA elements.
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