Interactions of the TnaC nascent peptide with rRNA in the exit tunnel enable the ribosome to respond to free tryptophan.
Interactions of the TnaC nascent peptide with rRNA in the exit tunnel enable the ribosome to respond to free tryptophan.
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DOI：
10.1093/nar/gkt923
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发表时间：
2014-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Cruz-Vera LR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Martínez AK;Gordon E;Sengupta A;Shirole N;Klepacki D;Martinez-Garriga B;Brown LM;Benedik MJ;Yanofsky C;Mankin AS;Vazquez-Laslop N;Sachs MS;Cruz-Vera LR
转录减弱机制调节细菌 tnaCAB 操纵子的表达。该机制需要由调节性新生 TnaC 肽响应游离 L-色氨酸 (L-Trp) 诱导核糖体停滞。在这项研究中，我们通过遗传和生化分析证明，在大肠杆菌中，TnaC 残基 I19 和 23S rRNA 核苷酸 A2058 对于核糖体感知游离 L-Trp 的能力至关重要。我们表明，23S rRNA 中的突变变化 A2058U 降低了 L-Trp 介导的 tna 操纵子诱导的浓度依赖性，而 TnaC I19L 变化抑制了这种表型，恢复了翻译 A2058U 突变核糖体对游离 L-Trp 的敏感性。这些发现表明，TnaC 残基 I19 和 23S rRNA 核苷酸 A2058 之间的相互作用有助于在翻译核糖体内创建调节性 L-Trp 结合位点。
A transcriptional attenuation mechanism regulates expression of the bacterial tnaCAB operon. This mechanism requires ribosomal arrest induced by the regulatory nascent TnaC peptide in response to free L-tryptophan (L-Trp). In this study we demonstrate, using genetic and biochemical analyses, that in Escherichia coli, TnaC residue I19 and 23S rRNA nucleotide A2058 are essential for the ribosome’s ability to sense free L-Trp. We show that the mutational change A2058U in 23S rRNA reduces the concentration dependence of L-Trp-mediated tna operon induction, whereas the TnaC I19L change suppresses this phenotype, restoring the sensitivity of the translating A2058U mutant ribosome to free L-Trp. These findings suggest that interactions between TnaC residue I19 and 23S rRNA nucleotide A2058 contribute to the creation of a regulatory L-Trp binding site within the translating ribosome.
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DOI：
10.1016/j.bbrc.2010.01.073
发表时间：
2010-02-26
影响因子：
3.1
作者：
Ito, Koreaki;Chiba, Shinobu;Pogliano, Kit
通讯作者：
Pogliano, Kit
影响因子：
64.5
作者：
Nakatogawa, H;Ito, K
通讯作者：
Ito, K
影响因子：
56.9
作者：
Cardinale, Christopher J.;Washburn, Robert S.;Nudler, Evgeny
通讯作者：
Nudler, Evgeny
影响因子：
14.9
作者：
Martinez, Allyson K.;Shirole, Nitin H.;Cruz-Vera, Luis R.
通讯作者：
Cruz-Vera, Luis R.
影响因子：
64.5
作者：
Bollenbach T;Quan S;Chait R;Kishony R
通讯作者：
Kishony R