Metagenomic pyrosequencing and microbial identification.
Metagenomic pyrosequencing and microbial identification.
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DOI：
10.1373/clinchem.2008.107565
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发表时间：
2009-05
影响因子：
9.3
通讯作者：
Versalovic J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Petrosino JF;Highlander S;Luna RA;Gibbs RA;Versalovic J
人类微生物组计划开创了人类宏基因组学和高通量下一代测序策略的新时代。这篇综述将描述宏基因组学的发展策略，特别强调DNA焦磷酸测序的核心技术。描述了微生物种群背景下微生物鉴定的挑战。16S rDNA扩增子和全基因组测序方法都可能对人类宏基因组学有用，并且正在部署许多生物信息学工具来处理如此大量的微生物序列多样性。宏基因组学或微生物群落的研究可能最终有助于更全面地了解人类健康，疾病易感性以及传染病和免疫介导疾病的病理生理学。
The Human Microbiome Project has ushered in a new era for human metagenomics and high-throughput next generation sequencing strategies. This review will describe evolving strategies in metagenomics with a special emphasis on the core technology of DNA pyrosequencing. The challenges of microbial identification in the context of microbial populations are described. Both 16S rDNA amplicon and whole genome sequencing approaches may be useful for human metagenomics, and numerous bio-informatics tools are being deployed to tackle such vast amounts of microbiological sequence diversity. Metagenomics or studies of microbial communities may ultimately contribute to a more comprehensive understanding of human health, disease susceptibilities, and the pathophysiology of infectious and immune-mediated diseases.
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影响因子：
5.8
作者：
Huber, T;Faulkner, G;Hugenholtz, P
通讯作者：
Hugenholtz, P
影响因子：
5.8
作者：
DeSantis, TZ;Dubosarskiy, I;Andersen, GL
通讯作者：
Andersen, GL
影响因子：
4.4
作者：
Ashelford, KE;Chuzhanova, NA;Weightman, AJ
通讯作者：
Weightman, AJ
DOI：
10.1073/pnas.0504666102
发表时间：
2005-09-06
影响因子：
11.1
作者：
Allander, T;Tammi, MT;Andersson, B
通讯作者：
Andersson, B
影响因子：
9.4
作者：
Flanagan, J. L.;Brodie, E. L.;Bristow, J.
通讯作者：
Bristow, J.