Kinase domain insertions define distinct roles of CLK kinases in SR protein phosphorylation.
Kinase domain insertions define distinct roles of CLK kinases in SR protein phosphorylation.
复制标题
DOI：
10.1016/j.str.2008.12.023
复制
发表时间：
2009-03-11
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Knapp S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bullock AN;Das S;Debreczeni JE;Rellos P;Fedorov O;Niesen FH;Guo K;Papagrigoriou E;Amos AL;Cho S;Turk BE;Ghosh G;Knapp S
剪接需要丝氨酸/丝氨酸丰富（SR）蛋白的可逆磷酸化，这指导真核mRNA中的剪接位点选择。这些磷酸化事件依赖于SR蛋白（SRPK）和cdc 2样激酶（CLK）家族。剪接因子的SRPK 1磷酸化受到特定对接相互作用的限制，而CLK活性受到较少限制。为了了解剪接因子靶向激酶之间的功能差异，我们确定了CLK 1和CLK 3的晶体结构。有趣的是，在CLKs中，SRPK 1对接位点被插入一个以前看不见的螺旋αH所阻断。此外，由于CLK特异性β7/8-发夹插入物，存在于相关促分裂原活化蛋白激酶（MAPK）中的底物对接槽是不可接近的。因此，不受约束的底物相互作用与确定的活性位点介导的底物特异性一起允许CLK完成剪接因子如ASF/SF 2的功能上重要的过度磷酸化。此外，尽管具有高序列保守性，但我们鉴定出了对CLK 1具有令人惊讶的同种型特异性而非对CLK 3具有特异性的抑制剂。
Splicing requires reversible phosphorylation of serine/arginine-rich (SR) proteins, which direct splice site selection in eukaryotic mRNA. These phosphorylation events are dependent on SR protein (SRPK) and cdc2-like kinase (CLK) families. SRPK1 phosphorylation of splicing factors is restricted by a specific docking interaction whereas CLK activity is less constrained. To understand functional differences between splicing factor targeting kinases, we determined crystal structures of CLK1 and CLK3. Intriguingly, in CLKs the SRPK1 docking site is blocked by insertion of a previously unseen helix αH. In addition, substrate docking grooves present in related mitogen activating protein kinases (MAPKs) are inaccessible due to a CLK specific β7/8-hairpin insert. Thus, the unconstrained substrate interaction together with the determined active-site mediated substrate specificity allows CLKs to complete the functionally important hyperphosphorylation of splicing factors like ASF/SF2. In addition, despite high sequence conservation, we identified inhibitors with surprising isoform specificity for CLK1 over CLK3.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1073/pnas.0708800104
发表时间：
2007-12-18
影响因子：
11.1
作者：
Fedorov, Oleg;Marsden, Brian;Knapp, Stefan
通讯作者：
Knapp, Stefan
影响因子：
3.5
作者：
Hartmann, AM;Rujescu, D;Stamm, S
通讯作者：
Stamm, S
影响因子：
3.7
作者：
Menegay, H;Moeslein, F;Landreth, G
通讯作者：
Landreth, G
影响因子：
7.3
作者：
Bullock, AN;Debreczeni, JÉ;Knapp, S
通讯作者：
Knapp, S
影响因子：
3.7
作者：
Duncan, PI;Stojdl, DF;Bell, JC
通讯作者：
Bell, JC