The Allplex 2019-nCoV (Seegene) assay: which performances are for SARS-CoV-2 infection diagnosis?
The Allplex 2019-nCoV (Seegene) assay: which performances are for SARS-CoV-2 infection diagnosis?
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DOI：
10.1007/s10096-020-03930-8
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发表时间：
2020-10
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
SARS-CoV-2 Foch Hospital study group
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Farfour E;Lesprit P;Visseaux B;Pascreau T;Jolly E;Houhou N;Mazaux L;Asso-Bonnet M;Vasse M;SARS-CoV-2 Foch Hospital study group
目前有几种SARS-CoV-2 RT-PCR的商业检测方法，但其中很少进行了评估。我们使用41份鼻咽样本对Allplex 2019-nCoV （Seegene）检测进行了评估。与GeneFinder COVID-19 plus （Elitech）和传染病专家诊断的符合率分别为92.7%和100%。4个样本显示E和RdRp基因的Ct < 22.0，而N基因未检测到，表明病毒序列存在变异性。与其他呼吸道病毒无交叉反应。Allplex 2019-nCoV似乎是一种可靠的方法，但需要使用更多样本进行额外评估。RT-PCR检测应该包括至少2个病毒靶标。
Several commercial assays for SARS-CoV-2 RT-PCR are available but few of them were assessed. We evaluate the Allplex 2019-nCoV (Seegene) assay using 41 nasopharyngeal samples. The rates of agreement were 92.7% and 100% with the GeneFinder COVID-19 plus (Elitech) and the diagnosis of the infectious disease specialist respectively. Four samples display a Ct < 22.0 for the E and RdRp genes while the N gene was not detected, suggesting a variability of the viral sequence. There was no cross-reactivity with other respiratory viruses. The Allplex 2019-nCoV appears as a reliable method, but additional evaluations using more samples are needed. RT-PCR assays should probably include at least 2 viral targets.
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