Chemical space guided discovery of antimicrobial bridged bicyclic peptides against Pseudomonas aeruginosa and its biofilms.
Chemical space guided discovery of antimicrobial bridged bicyclic peptides against Pseudomonas aeruginosa and its biofilms.
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DOI：
10.1039/c7sc01314k
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发表时间：
2017-10-01
期刊：
影响因子：
8.4
通讯作者：
Reymond JL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Di Bonaventura I;Jin X;Visini R;Probst D;Javor S;Gan BH;Michaud G;Natalello A;Doglia SM;Köhler T;van Delden C;Stocker A;Darbre T;Reymond JL
在这里，我们使用了一种新的策略来探索多肽化学空间，以发现双环抗菌肽。在这里，我们报告了抗菌桥联双环肽(AMBP)的发现，它对医院环境中的一种高度有问题的革兰氏阴性细菌铜绿假单胞菌具有活性。其中两种AMBP显示出很强的生物被膜抑制和分散活性，并增强了多粘菌素的活性，多粘菌素目前是一种最后的抗生素，正在出现耐药性。为了发现我们的AMBP，我们使用了小分子药物发现领域中众所周知的化学空间的概念来定义少量用于合成和实验评估的测试化合物。我们的化学空间是用2DP计算的，这是一种新的多肽拓扑形状和药效团指纹图谱。该方法为寻找具有特殊拓扑结构的生物活性多肽，扩大多肽类药物的结构多样性提供了一种通用的策略。
Here we used a new strategy for exploring the peptide chemical space to discover bicyclic antimicrobial peptides. Herein we report the discovery of antimicrobial bridged bicyclic peptides (AMBPs) active against Pseudomonas aeruginosa, a highly problematic Gram negative bacterium in the hospital environment. Two of these AMBPs show strong biofilm inhibition and dispersal activity and enhance the activity of polymyxin, currently a last resort antibiotic against which resistance is emerging. To discover our AMBPs we used the concept of chemical space, which is well known in the area of small molecule drug discovery, to define a small number of test compounds for synthesis and experimental evaluation. Our chemical space was calculated using 2DP, a new topological shape and pharmacophore fingerprint for peptides. This method provides a general strategy to search for bioactive peptides with unusual topologies and expand the structural diversity of peptide-based drugs.
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影响因子：
--
作者：
de la Fuente-Núñez C;Reffuveille F;Mansour SC;Reckseidler-Zenteno SL;Hernández D;Brackman G;Coenye T;Hancock RE
通讯作者：
Hancock RE
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Funken H;Bartels KM;Wilhelm S;Brocker M;Bott M;Bains M;Hancock RE;Rosenau F;Jaeger KE
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