The pain interactome: connecting pain-specific protein interactions.
The pain interactome: connecting pain-specific protein interactions.
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DOI：
10.1016/j.pain.2014.06.020
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发表时间：
2014-11
期刊：
影响因子：
7.4
通讯作者：
Sidders B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jamieson DG;Moss A;Kennedy M;Jones S;Nenadic G;Robertson DL;Sidders B
来自疼痛状态的蛋白质相互作用形成了一个连贯的网络，可以用来为进一步的研究提供信息。我们确定了疼痛子网络的关键蛋白质。了解与疾病相关的分子机制是现代医学研究的中心目标。因此，已经发表了数千个实验，详细说明了导致疾病的单个分子事件。在这里，我们使用半自动化的文本挖掘方法来准确和详尽地策划慢性疼痛状态的主要文献。通过这样做，我们创建了一个由1,002种与疼痛特异性相关的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）组成的综合网络。PPI形成了一个高度互连和连贯的结构，由此产生的网络提供了一种替代方案，而这些替代方案是通过使用尚未显示在疼痛状态下发生的相互作用来连接与疼痛相关的基因。我们利用与我们的互动相关的上下文数据来分析特定于炎症和神经性疼痛以及各种解剖区域的子网络。在这里，我们确定了进一步研究的潜在目标和几个药物再利用的机会。最后，该网络提供了一个框架，用于解释疼痛领域内的新数据。
Protein interactions from painful states form a coherent network that can be used to inform further study. We identify proteins key to painful subnetworks. Understanding the molecular mechanisms associated with disease is a central goal of modern medical research. As such, many thousands of experiments have been published that detail individual molecular events that contribute to a disease. Here we use a semi-automated text mining approach to accurately and exhaustively curate the primary literature for chronic pain states. In so doing, we create a comprehensive network of 1,002 contextualized protein–protein interactions (PPIs) specifically associated with pain. The PPIs form a highly interconnected and coherent structure, and the resulting network provides an alternative to those derived from connecting genes associated with pain using interactions that have not been shown to occur in a painful state. We exploit the contextual data associated with our interactions to analyse subnetworks specific to inflammatory and neuropathic pain, and to various anatomical regions. Here, we identify potential targets for further study and several drug-repurposing opportunities. Finally, the network provides a framework for the interpretation of new data within the field of pain.
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DOI：
10.1093/database/bat033
发表时间：
2013
期刊：
Database : the journal of biological databases and curation
影响因子：
--
作者：
Jamieson DG;Roberts PM;Robertson DL;Sidders B;Nenadic G
通讯作者：
Nenadic G
影响因子：
64.8
作者：
Jeong, H;Mason, SP;Oltvai, ZN
通讯作者：
Oltvai, ZN
影响因子：
25
作者：
Ferrini F;Trang T;Mattioli TA;Laffray S;Del'Guidice T;Lorenzo LE;Castonguay A;Doyon N;Zhang W;Godin AG;Mohr D;Beggs S;Vandal K;Beaulieu JM;Cahill CM;Salter MW;De Koninck Y
通讯作者：
De Koninck Y
影响因子：
7.4
作者：
Finnerup, Nanna Brix;Sindrup, Soren Hein;Jensen, Troels Staehelin
通讯作者：
Jensen, Troels Staehelin
影响因子：
120.7
作者：
Gureje, O;Von Korff, M;Gater, R
通讯作者：
Gater, R