Genome-wide analysis of transcription factor-binding sites in skeletal muscle cells using ChIP-seq.
Genome-wide analysis of transcription factor-binding sites in skeletal muscle cells using ChIP-seq.
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使用 ChIP-seq 对骨骼肌细胞中转录因子结合位点进行全基因组分析。
DOI：
10.1007/978-1-62703-607-8_4
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发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Hagiwara,Nobuko
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
An,Chung-Ii;Hagiwara,Nobuko
基因表达的转录调控构成了许多发育过程的基本机制。因此，识别和表征转录因子的结合位点对于揭示特定发育过程的机制是重要的。在这里，我们描述了详细的程序，全基因组分析的结合位点的转录因子参与骨骼肌的纤维型分化。通过进行ChIP-seq，然后进行一系列下游分析，可以以全基因组的方式获得有关转录因子结合位点的深入信息。
Transcriptional regulation of gene expression constitutes a fundamental mechanism of many developmental processes. Therefore, identification and characterization of binding sites of transcription factors are important for uncovering the mechanisms of a particular developmental process. Here, we describe detailed procedures for genome-wide analysis of binding sites of a transcription factor involved in the fiber-type differentiation of skeletal muscle. By conducting ChIP-seq followed by a series of downstream analyses, in-depth information on binding sites of transcription factors can be obtained in a genome-wide manner.
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