The bacteriophage T4 AsiA protein contacts the β-flap domain of RNA polymerase
The bacteriophage T4 AsiA protein contacts the β-flap domain of RNA polymerase
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噬菌体 T4 AsiA 蛋白接触 RNA 聚合酶的 β-flap 结构域
DOI：
--
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发表时间：
2009
影响因子：
11.1
通讯作者：
A. Hochschild
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Andy H. Yuan;Bryce E. Nickels;A. Hochschild
为了从特定启动子启动转录，细菌RNA聚合酶（RNAP）核心酶必须与起始因子σ结合，所述起始因子σ包含允许与启动子DNA序列特异性相互作用的决定簇。大多数细菌含有几个σ因子，每个因子指导识别一组不同的启动子。称为“抗σ因子”的蛋白质的大的且多样的家族通过靶向特异性σ因子来调节启动子利用。这个家族的创始成员是噬菌体T4的AsiA蛋白。AsiA特异性靶向大肠杆菌中的主要σ因子σ70，并抑制主要类别的σ70依赖性启动子的转录。AsiA依赖性转录抑制归因于AsiA与σ70保守区4之间的充分记录的相互作用。在这里，我们建立了有效的AsiA依赖性转录抑制也需要AsiA和RNAP核心之间的直接蛋白质-蛋白质接触。特别是，我们证明了AsiA接触RNAP β亚基的瓣结构域（β瓣）。我们的研究结果支持了一种新的观点，即β瓣是调节蛋白的靶位点，在转录周期的所有阶段影响RNAP功能。
To initiate transcription from specific promoters, the bacterial RNA polymerase (RNAP) core enzyme must associate with the initiation factor σ, which contains determinants that allow sequence-specific interactions with promoter DNA. Most bacteria contain several σ factors, each of which directs recognition of a distinct set of promoters. A large and diverse family of proteins known as “anti-σ factors” regulates promoter utilization by targeting specific σ factors. The founding member of this family is the AsiA protein of bacteriophage T4. AsiA specifically targets the primary σ factor in Escherichia coli, σ70, and inhibits transcription from the major class of σ70-dependent promoters. AsiA-dependent transcription inhibition has been attributed to a well-documented interaction between AsiA and conserved region 4 of σ70. Here, we establish that efficient AsiA-dependent transcription inhibition also requires direct protein–protein contact between AsiA and the RNAP core. In particular, we demonstrate that AsiA contacts the flap domain of the RNAP β-subunit (the β-flap). Our findings support the emerging view that the β-flap is a target site for regulatory proteins that affect RNAP function during all stages of the transcription cycle.
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噬菌体 T4 AsiA 对大肠杆菌 RNA 聚合酶的抑制。
DOI：
10.1006/jmbi.1998.1742
发表时间：
1998
期刊：
Journal of molecular biology.
影响因子：
--
作者：
Severinova,E;Severinov,K;Darst,SA
通讯作者：
Darst,SA
影响因子：
16
作者：
E. Campbell;Oriana Muzzin;M. Chlenov;Jing L. Sun;C. Olson;O. Weinman;Michelle Trester-Zedlitz;S. Darst
通讯作者：
E. Campbell;Oriana Muzzin;M. Chlenov;Jing L. Sun;C. Olson;O. Weinman;Michelle Trester-Zedlitz;S. Darst
分析噬菌体 T4 AsiA 蛋白内涉及其与大肠杆菌 RNA 聚合酶 sigma70 亚基结合及其作为转录抑制剂和共激活剂的作用的区域。
影响因子：
5.6
作者：
Pal,Debashis;Vuthoori,Madhavi;Pande,Suchira;Wheeler,David;Hinton,DeborahM
通讯作者：
Hinton,DeborahM
影响因子：
10.5
作者：
Dove, SL;Hochschild, A
通讯作者：
Hochschild, A
His 暂停 RNA 发夹与 RNA 聚合酶 β 亚基残基 904-950 的优先相互作用与强转录暂停相关。
DOI：
10.1073/pnas.94.16.8433
发表时间：
1997
影响因子：
11.1
作者：
Wang,D;Severinov,K;Landick,R
通讯作者：
Landick,R