CellProfiler: image analysis software for identifying and quantifying cell phenotypes.
CellProfiler: image analysis software for identifying and quantifying cell phenotypes.
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DOI：
10.1186/gb-2006-7-10-r100
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发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Sabatini DM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Carpenter AE;Jones TR;Lamprecht MR;Clarke C;Kang IH;Friman O;Guertin DA;Chang JH;Lindquist RA;Moffat J;Golland P;Sabatini DM
描述了CellProfiler，第一个用于灵活和高通量细胞图像分析的免费、开源系统。生物学家现在可以使用自动化技术每天准备数千个样本并对其成像，从而实现化学筛选和功能基因组学(例如，使用RNA干扰)。在这里，我们描述了第一个为灵活、高通量细胞图像分析而设计的免费、开源系统--CellProfiler。CellProfiler可以定量地解决各种生物学问题，包括标准分析(例如，细胞计数、大小、每个细胞的蛋白质水平)和复杂的形态分析(例如，细胞/细胞器形状或DNA或蛋白质染色的亚细胞模式)。
CellProfiler, the first free, open-source system for flexible and high-throughput cell image analysis is described. Biologists can now prepare and image thousands of samples per day using automation, enabling chemical screens and functional genomics (for example, using RNA interference). Here we describe the first free, open-source system designed for flexible, high-throughput cell image analysis, CellProfiler. CellProfiler can address a variety of biological questions quantitatively, including standard assays (for example, cell count, size, per-cell protein levels) and complex morphological assays (for example, cell/organelle shape or subcellular patterns of DNA or protein staining).
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