Plant N-glycan breakdown by human gut Bacteroides
Plant N-glycan breakdown by human gut Bacteroides
复制标题
人类肠道拟杆菌对植物 N-聚糖的分解
DOI：
10.1101/2022.04.07.487459
复制
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Crouch L
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Crouch L
人类结肠微生物群可获得的主要营养素是来自饮食的复合聚糖。为了降解这种高度可变的糖结构混合物，肠道微生物已经获得了大量不同的碳水化合物活性酶（CAZymes），主要是糖苷水解酶，其中许多具有可用于一系列不同应用的特异性。植物N-聚糖普遍存在于植物产生的蛋白质中，因此也是饮食的组成部分，但肠道微生物群对这些复杂分子的分解还没有研究。植物N-聚糖也是花粉和一些植物性食品中的过敏原，当植物用于医疗应用的异源蛋白质生产时，存在的N-聚糖可能对治疗功能和稳定性构成风险。在这里，我们使用一种新的基因组关联的方法来发现酶，以确定一个gutBacteroidesspecies编码的植物复合N-聚糖的分解途径，并生化表征涉及的五种CA酶，包括PNGase和GH 92 α-甘露糖苷酶的结构。这些酶为植物N-聚糖的修饰提供了一个工具箱，用于一系列潜在的应用。此外，关键的PNGase还具有针对昆虫型N-聚糖的活性，我们从昆虫作为营养源的角度进行了讨论。
The major nutrients available to the human colonic microbiota are complex glycans derived from the diet. To degrade this highly variable mix of sugar structures, gut microbes have acquired a huge array of different carbohydrate-active enzymes (CAZymes), predominantly glycoside hydrolases, many of which have specificities that can be exploited for a range of different applications. PlantN-glycans are prevalent on proteins produced by plants and thus components of the diet, but the breakdown of these complex molecules by the gut microbiota has not been explored. PlantN-glycans are also well characterized allergens in pollen and some plant-based foods, and when plants are used in heterologous protein production for medical applications, theN-glycans present can pose a risk to therapeutic function and stability. Here we use a novel genome association approach for enzyme discovery to identify a breakdown pathway for plant complexN-glycans encoded by a gutBacteroidesspecies and biochemically characterize five CAZymes involved, including structures of the PNGase and GH92 α-mannosidase. These enzymes provide a toolbox for the modification of plantN-glycans for a range of potential applications. Furthermore, the keystone PNGase also has activity against insect-typeN-glycans, which we discuss from the perspective of insects as a nutrient source.
登录
查看更多内容
一致。
DOI：
10.1097/iae.0000000000001602
发表时间：
2017
期刊：
Retina (Philadelphia, Pa.)
影响因子：
--
作者：
Todorich,Bozho;Thanos,Aristomenis;Yonekawa,Yoshihiro;Thomas,BenjaminJ;Faia,LisaJ;Chang,Emmanuel;Shulman,Julia;Olsen,KarlR;Blair,MichaelP;Shapiro,MichaelP;Ferrone,Philip;Vajzovic,Lejla;Toth,CynthiaA;Lee,ThomasC;Robinson,
通讯作者：
Robinson,
影响因子：
14.8
作者：
Zhu Y;Suits MD;Thompson AJ;Chavan S;Dinev Z;Dumon C;Smith N;Moremen KW;Xiang Y;Siriwardena A;Williams SJ;Gilbert HJ;Davies GJ
通讯作者：
Davies GJ
影响因子：
64.8
作者：
Cuskin F;Lowe EC;Temple MJ;Zhu Y;Cameron E;Pudlo NA;Porter NT;Urs K;Thompson AJ;Cartmell A;Rogowski A;Hamilton BS;Chen R;Tolbert TJ;Piens K;Bracke D;Vervecken W;Hakki Z;Speciale G;Munōz-Munōz JL;Day A;Peña MJ;McLean R;Suits MD;Boraston AB;Atherly T;Ziemer CJ;Williams SJ;Davies GJ;Abbott DW;Martens EC;Gilbert HJ
通讯作者：
Gilbert HJ
影响因子：
4.3
作者：
GarciaCasado, G;SanchezMonge, R;Gomez, L
通讯作者：
Gomez, L
拟杆菌采集甘露糖 β-甘露糖苷酶 Man2A 的结构和特异性
DOI：
--
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
--
作者：
L. Tailford;V. A. Money;N. Smith;Claire Dumon;G. Davies;H. Gilbert
通讯作者：
H. Gilbert