Observing 3-hydroxyanthranilate-3,4-dioxygenase in action through a crystalline lens
Observing 3-hydroxyanthranilate-3,4-dioxygenase in action through a crystalline lens
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通过晶状体观察 3-羟基邻氨基苯甲酸-3,4-双加氧酶的作用
DOI：
10.1073/pnas.2005327117
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Liu, Aimin
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wang, Yifan;Liu, Kathy Fange;Yang, Yu;Davis, Ian;Liu, Aimin
由色氨酸合成喹啉酸是哺乳动物从头合成烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD+）的关键步骤。在此，非血红素铁基3-羟基邻氨基苯甲酸-3，4-双加氧酶负责喹啉酸的生产进行了研究，通过进行时间resolvedin晶体反应监测的紫外-可见光谱，电子顺磁共振（EPR）光谱，和X-射线晶体学。七个催化中间体的动力学和结构解析的结晶状态，并伴随蛋白质的构象变化，在活性位点。其中，一个单氧，七元内酯中间体作为一个单齿配体的铁中心在1.59-ε分辨率被捕获，这大概对应于通过EPR观察到的基于衬底的自由基物种使用小尺寸的单晶浆料。其他结构快照确定在约2.0倍分辨率包括单齿和随后的二齿协调基板，superoxo，烷基过氧，和两个金属结合的烯醇互变异构体的不稳定的双加氧酶产品。这些结果揭示了详细的逐步O-原子转移双加氧酶机制沿着潜在的异构化活性，其微调产物谱并影响代谢途径交界处喹啉酸的产生。
The synthesis of quinolinic acid from tryptophan is a critical step in the de novo biosynthesis of nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) in mammals. Herein, the nonheme iron-based 3-hydroxyanthranilate-3,4-dioxygenase responsible for quinolinic acid production was studied by performing time-resolvedin crystalloreactions monitored by UV-vis microspectroscopy, electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy, and X-ray crystallography. Seven catalytic intermediates were kinetically and structurally resolved in the crystalline state, and each accompanies protein conformational changes at the active site. Among them, a monooxygenated, seven-membered lactone intermediate as a monodentate ligand of the iron center at 1.59-Å resolution was captured, which presumably corresponds to a substrate-based radical species observed by EPR using a slurry of small-sized single crystals. Other structural snapshots determined at around 2.0-Å resolution include monodentate and subsequently bidentate coordinated substrate, superoxo, alkylperoxo, and two metal-bound enol tautomers of the unstable dioxygenase product. These results reveal a detailed stepwise O-atom transfer dioxygenase mechanism along with potential isomerization activity that fine-tunes product profiling and affects the production of quinolinic acid at a junction of the metabolic pathway.
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通过晶状体观察裂环双加氧酶的作用——静息态结构
DOI：
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发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
--
作者：
Y. Wang;F. Liu;Y. Yang;A. Liu
通讯作者：
A. Liu
通过晶状体观察开环双加氧酶的作用 - ACMS 双齿结合结构的烯醇互变异构体
DOI：
--
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
--
作者：
Y. Wang;F. Liu;Y. Yang;A. Liu
通讯作者：
A. Liu
牛肝中 3-羟基邻氨基苯甲酸 3,4-双加氧酶的纯化和灭活。
DOI：
10.1016/s1357-2725(02)00347-3
发表时间：
2003
期刊：
The international journal of biochemistry & cell biology
影响因子：
--
作者：
Nandi,Dhirendra;Lightcap,EricS;Koo,YumeeKim;Lu,Xingliang;Quancard,Jean;Silverman,RichardB
通讯作者：
Silverman,RichardB
影响因子：
4.8
作者：
Yang, Yu;Davis, Ian;Liu, Aimin
通讯作者：
Liu, Aimin
来自Cupriavidus Metallidurans 的3-羟基邻氨基苯甲酸-3,4-双加氧酶I142A 与4-Cl-3-HAA 复合物的晶体结构
DOI：
--
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
--
作者：
Yu Yang;Fange Liu;Aimin Liu
通讯作者：
Aimin Liu