CHROMIXS: automatic and interactive analysis of chromatography-coupled small-angle X-ray scattering data.
CHROMIXS: automatic and interactive analysis of chromatography-coupled small-angle X-ray scattering data.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btx846
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发表时间：
2018-06-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Svergun DI
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Panjkovich A;Svergun DI
尺寸排阻色谱(SEC)与小角X射线散射(SAXS)联用，也称为联用SEC-SAXS，正越来越多地被用于生物大分子、络合物和溶液混合物的结构分析。一次SEC-SAXS运行从洗脱的溶质中产生数千个单独的SAXS图谱，它们的分析需要正确识别缓冲区和样品区，这是一项相当费力的任务。我们介绍了CHROMIXS(正如在层析在线X射线散射中)，这是一个用于自动和交互地快速还原和分析SEC-SAXS数据的程序。作为ATSAS软件套件(www.embl-hamburg.de/biosaxs/download.html)的一部分，学术用户可以免费获得CHROMIXS。
Size-exclusion chromatography (SEC) coupled to small-angle X-ray scattering (SAXS), also known as inline SEC-SAXS, is being increasingly used for the structural analysis of biological macromolecules, complexes and mixtures in solution. A single SEC-SAXS run generates thousands of individual SAXS profiles from the eluting solute and their analysis requires a correct identification of buffer and sample regions, a rather laborous task. We present CHROMIXS (as in CHROMatography Inline X-ray Scattering), a program for rapid reduction and analysis, both automatically and interactively, of SEC-SAXS data. CHROMIXS is freely available to academic users as part of the ATSAS software suite (www.embl-hamburg.de/biosaxs/download.html).
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