5'-Bromouridine IP Chase (BRIC)-Seq to Determine RNA Half-Lives.
5'-Bromouridine IP Chase (BRIC)-Seq to Determine RNA Half-Lives.
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5-溴尿苷 IP Chase (BRIC)-Seq 确定 RNA 半衰期。
DOI：
10.1007/978-1-4939-7540-2_1
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发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Akimitsu N.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yamada T;Imamachi N;Onoguchi-Mizutani R;Imamura K;Suzuki Y;Akimitsu N.
全基因组水平的RNA稳定性分析是RNA生物学中的一种先进方法，它可以检测每个转录本的半衰期。特别地，使用尿苷类似物的脉冲标记方法使得能够在生理上不受干扰的条件下测定每个转录物的半衰期。该技术涉及用5′-溴尿苷（BrU）脉冲标记哺乳动物细胞中的内源性RNA，然后使用深度测序（BRIC-seq）测量BrU标记的RNA的时间顺序减少。在这里，我们描述了BRIC-seq的详细协议和技术提示。
Analysis of RNA stability at genome-wide level is an advanced method in RNA biology that examines the half-life of each transcript. In particular, a pulse-labeling method using uridine analogs enables the determination of half-life of each transcript under physiologically undisturbed conditions. The technique involves pulse labeling of endogenous RNAs in mammalian cells with 5′-bromouridine (BrU), followed by measuring the chronological decrease of BrU-labeled RNAs using deep sequencing (BRIC-seq). Here, we describe a detailed protocol and technical tips for BRIC-seq.
影响因子：
7
作者：
Tani H;Mizutani R;Salam KA;Tano K;Ijiri K;Wakamatsu A;Isogai T;Suzuki Y;Akimitsu N
通讯作者：
Akimitsu N
影响因子：
7
作者：
Windhager L;Bonfert T;Burger K;Ruzsics Z;Krebs S;Kaufmann S;Malterer G;L'Hernault A;Schilhabel M;Schreiber S;Rosenstiel P;Zimmer R;Eick D;Friedel CC;Dölken L
通讯作者：
Dölken L
影响因子：
5.3
作者：
Grigull, J;Mnaimneh, S;Hughes, TR
通讯作者：
Hughes, TR