A taxonomy for reproducible and replicable research in environmental modelling
A taxonomy for reproducible and replicable research in environmental modelling
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环境建模中可重复和可复制研究的分类法
DOI：
10.1016/j.envsoft.2020.104753
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发表时间：
2020
影响因子：
4.9
通讯作者：
Malik, Tanu
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Essawy, Bakinam T.;Goodall, Jonathan L.;Voce, Daniel;Morsy, Mohamed M.;Sadler, Jeffrey M.;Choi, Young Don;Tarboton, David G.;Malik, Tanu
尽管越来越多的人认识到计算科学中的再现性危机，但在许多计算领域（包括环境建模）中，究竟什么构成了可再现或可复制的研究仍然缺乏明确性。为此，我们提出了一个分类法，将环境建模研究定义为1）可重复的，2）可运行的，3）可重现的，或4）可复制的。我们介绍这些术语与说明性的例子，从水文学使用水文建模框架沿着与网络基础设施，旨在促进可重复性。使用这种分类法作为指导，我们认为，集装箱化是一个重要的，但缺乏必要的组成部分，以实现水文和环境建模的计算再现性的目标。水文学的例子，以证明新的工具，包括一个用户友好的工具，集装箱化的计算分析称为Sciunit，可以降低环境建模社区的再现性和可复制性的障碍。
Despite the growing acknowledgment of reproducibility crisis in computational science, there is still a lack of clarity around what exactly constitutes a reproducible or replicable study in many computational fields, including environmental modelling. To this end, we put forth a taxonomy that defines an environmental modelling study as being either 1) repeatable, 2) runnable, 3) reproducible, or 4) replicable. We introduce these terms with illustrative examples from hydrology using a hydrologic modelling framework along with cyberinfrastructure aimed at fostering reproducibility. Using this taxonomy as a guide, we argue that containerization is an important but lacking component needed to achieve the goal of computational reproducibility in hydrology and environmental modelling. Examples from hydrology are provided to demonstrate how new tools, including a user-friendly tool for containerization of computational analyses called Sciunit, can lower the barrier to reproducibility and replicability in the environmental modelling community.
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利用可重复使用的研究对象的来源
影响因子：
--
作者：
Yuan, Zhihao;Ton That, Dai;Kothari, Siddhant;Fils, Gabriel;Malik, Tanu
通讯作者：
Malik, Tanu
Sciunits：可重复使用的研究对象
DOI：
10.1109/escience.2017.51
发表时间：
2017
期刊：
IEEE 13th International Conference on e-Science (e-Science
影响因子：
--
作者：
Ton That, Dai Hai;Fils, Gabriel;Yuan, Zhihao;Malik, Tanu
通讯作者：
Malik, Tanu
集成科学网络基础设施以提高计算水文学的可重复性：HydroShare 和 GeoTrust 示例
影响因子：
4.9
作者：
Essawy, Bakinam T.;Goodall, Jonathan L.;Zell, Wesley;Voce, Daniel;Morsy, Mohamed M.;Sadler, Jeffrey;Yuan, Zhihao;Malik, Tanu
通讯作者：
Malik, Tanu
评估用于描述传统水文建模软件元数据的 OntoSoft 本体
影响因子：
4.9
作者：
Bakinam T. Essawy;J. Goodall;Hao Xu;Y. Gil
通讯作者：
Y. Gil
通过可执行的研究纲要开启出版流程
DOI：
10.1045/january2017-nuest
发表时间：
2017
期刊：
D Lib Mag.
影响因子：
--
作者：
Daniel Nüst;M. Konkol;E. Pebesma;C. Kray;Marc Schutzeichel;H. Przibytzin;Jörg Lorenz
通讯作者：
Jörg Lorenz