Modeling Stripe Formation on Growing Zebrafish Tailfins
Modeling Stripe Formation on Growing Zebrafish Tailfins
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斑马鱼尾鳍生长过程中条纹形成的建模
DOI：
10.1007/s11538-020-00731-0
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发表时间：
2020
影响因子：
3.5
通讯作者：
Sandstede, B.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Volkening, A.;Abbott, M. R.;Chandra, N.;Dubois, B.;Lim, F.;Sexton, D.;Sandstede, B.
随着斑马鱼的发育，由于色彩鲜艳的色素细胞的相互作用，它们的皮肤上形成了黑色和金色的条纹。这些特征图案出现在生长中的鱼身上，以及肛门和尾鳍上。当野生型条纹与身体上的水平标记平行时，尾鳍上的图案逐渐向远处向外延伸。有趣的是，一些突变会导致身体模式的改变，而不会影响鳍纹。通过探索性建模方法，我们的目标是帮助更好地理解身体和鳍图案之间的这些差异。通过采用基于先验智能体的鱼体内细胞相互作用模型，我们提出了一项关于尾鳍条纹发育的计算机研究。我们的主要结果是证明了两种细胞类型可以在尾鳍上产生条纹。我们强调了骨射线、生长和体鳍界面可能参与图案的几种方式，并为未来与图案稳健性相关的工作提出了问题。
As zebrafish develop, black and gold stripes form across their skin due to the interactions of brightly colored pigment cells. These characteristic patterns emerge on the growing fish body, as well as on the anal and caudal fins. While wild-type stripes form parallel to a horizontal marker on the body, patterns on the tailfin gradually extend distally outward. Interestingly, several mutations lead to altered body patterns without affecting fin stripes. Through an exploratory modeling approach, our goal is to help better understand these differences between body and fin patterns. By adapting a prior agent-based model of cell interactions on the fish body, we present an in silico study of stripe development on tailfins. Our main result is a demonstration that two cell types can produce stripes on the caudal fin. We highlight several ways that bone rays, growth, and the body–fin interface may be involved in patterning, and we raise questions for future work related to pattern robustness.
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影响因子：
3.5
作者：
Painter, K. J.;Bloomfield, J. M.;Gerisch, A.
通讯作者：
Gerisch, A.
淡水鱼
DOI：
--
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
--
作者：
L. E. Ude
通讯作者：
L. E. Ude
Delta/Notch 信号传导参与斑马鱼成体色素条纹图案
影响因子：
4.6
作者：
H. Hamada;Masakatsu Watanabe;H. Lau;T. Nishida;T. Hasegawa;D. Parichy;Shigeru Kondo
通讯作者：
Shigeru Kondo
DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
--
影响因子：
--
作者：
S. S. Lopes-S.;X. Y. Yang;J. Carney;A. R. Rauch;G.-J Jacoby;A. S. Hurst;R. Johnson;S. L. Ward;A. Kelsh;S. S. Lopes-S.;Xueyan a;Yang;Jeanette Mü Ller;T. Carney;Anthony R. McAdow;Gerd-Jörg Rauch;A. Jacoby;L. Hurst;Mariana Delfino-Machín;P. Haffter;R. Geisler;Stephen L. Johnson;A. Ward;R. Kelsh;Greg Barsh;Stanford
通讯作者：
S. S. Lopes-S.;X. Y. Yang;J. Carney;A. R. Rauch;G.-J Jacoby;A. S. Hurst;R. Johnson;S. L. Ward;A. Kelsh;S. S. Lopes-S.;Xueyan a;Yang;Jeanette Mü Ller;T. Carney;Anthony R. McAdow;Gerd-Jörg Rauch;A. Jacoby;L. Hurst;Mariana Delfino-Machín;P. Haffter;R. Geisler;Stephen L. Johnson;A. Ward;R. Kelsh;Greg Barsh;Stanford
DOI：
10.1111/j.1600-0749.2006.00311.x
发表时间：
2006-06
期刊：
Pigment cell research
影响因子：
--
作者：
Eve M. Mellgren;Stephen L. Johnson
通讯作者：
Eve M. Mellgren;Stephen L. Johnson