Global Profiling of the Cellular Alternative RNA Splicing Landscape during Virus-Host Interactions.
Global Profiling of the Cellular Alternative RNA Splicing Landscape during Virus-Host Interactions.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0161914
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发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Bisaillon M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Boudreault S;Martenon-Brodeur C;Caron M;Garant JM;Tremblay MP;Armero VE;Durand M;Lapointe E;Thibault P;Tremblay-Létourneau M;Perreault JP;Scott MS;Lemay G;Bisaillon M
选择性剪接 (AS) 是遗传调控的核心机制，可修改高等真核生物中 RNA 转录本的序列。 AS 已被证明可以通过差异选择成熟 mRNA 中包含的外显子来改变所得蛋白质的组成，从而增加细胞蛋白质组的变异性和多样性。在本研究中，以哺乳动物呼肠孤病毒为模型，研究了病毒感染后细胞基因整体 RNA 剪接景观的变化。我们的研究首次全面描述了真核细胞感染人类病毒后 RNA 剪接特征的整体变化。我们鉴定了 240 个感染后修饰的选择性剪接事件，这些事件属于经常参与基因表达和 RNA 代谢调节的转录本。使用质谱法，我们还确认了病毒感染细胞中 AS 产生的转录特异性肽的修饰。这些发现为病毒与宿主相互作用的复杂性提供了更多见解，因为这些剪接变体在病毒感染期间扩大了蛋白质组多样性和功能。
Alternative splicing (AS) is a central mechanism of genetic regulation which modifies the sequence of RNA transcripts in higher eukaryotes. AS has been shown to increase both the variability and diversity of the cellular proteome by changing the composition of resulting proteins through differential choice of exons to be included in mature mRNAs. In the present study, alterations to the global RNA splicing landscape of cellular genes upon viral infection were investigated using mammalian reovirus as a model. Our study provides the first comprehensive portrait of global changes in the RNA splicing signatures that occur in eukaryotic cells following infection with a human virus. We identify 240 modified alternative splicing events upon infection which belong to transcripts frequently involved in the regulation of gene expression and RNA metabolism. Using mass spectrometry, we also confirm modifications to transcript-specific peptides resulting from AS in virus-infected cells. These findings provide additional insights into the complexity of virus-host interactions as these splice variants expand proteome diversity and function during viral infection.
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DOI：
10.1074/mcp.m115.048991
发表时间：
2015-07
期刊：
Molecular & cellular proteomics : MCP
影响因子：
--
作者：
Drissi R;Dubois ML;Douziech M;Boisvert FM
通讯作者：
Boisvert FM
影响因子：
56.9
作者：
Enninga, J;Levy, DE;Fontoura, BMA
通讯作者：
Fontoura, BMA
影响因子：
14.9
作者：
CORPET, F
通讯作者：
CORPET, F
用双功能寡核苷酸重定向剪接。
影响因子：
14.9
作者：
Brosseau JP;Lucier JF;Lamarche AA;Shkreta L;Gendron D;Lapointe E;Thibault P;Paquet E;Perreault JP;Abou Elela S;Chabot B
通讯作者：
Chabot B
模因套件：用于发现和搜索的工具。
影响因子：
14.9
作者：
Bailey TL;Boden M;Buske FA;Frith M;Grant CE;Clementi L;Ren J;Li WW;Noble WS
通讯作者：
Noble WS