Global analysis of short RNAs reveals widespread promoter-proximal stalling and arrest of Pol II in Drosophila.
Global analysis of short RNAs reveals widespread promoter-proximal stalling and arrest of Pol II in Drosophila.
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DOI：
10.1126/science.1181421
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发表时间：
2010-01-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Adelman K
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Nechaev S;Fargo DC;dos Santos G;Liu L;Gao Y;Adelman K
新出现的证据表明，在高等生物体中的基因表达的RNA聚合酶II在早期转录延伸停滞调节。为了探索负责这种调节的机制，我们开发了分离和表征果蝇细胞中停滞的RNA聚合酶II的短RNA的方法。这些短RNA的显着水平产生超过三分之一的所有基因，表明启动子近端失速是早期聚合酶延伸的一般特征。最初转录的序列的核苷酸组合物通过使聚合酶延伸复合物高度容易回溯和停滞在促进转录停滞中发挥重要作用。这些结果表明，早期伸长的内在效率可以极大地影响基因表达。
Emerging evidence indicates that gene expression in higher organisms is regulated by RNA polymerase II stalling during early transcription elongation. To probe the mechanisms responsible for this regulation, we developed methods to isolate and characterize short RNAs derived from stalled RNA polymerase II in Drosophila cells. Significant levels of these short RNAs were generated from over one third of all genes, indicating that promoter-proximal stalling is a general feature of early polymerase elongation. Nucleotide composition of the initially transcribed sequence played an important role in promoting transcriptional stalling by rendering polymerase elongation complexes highly susceptible to backtracking and arrest. These results indicate that the intrinsic efficiency of early elongation can greatly affect gene expression.
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影响因子：
5.3
作者：
Lee, Chanhyo;Li, Xiaoyong;Gilmour, David S.
通讯作者：
Gilmour, David S.
DOI：
10.1073/pnas.90.17.7923
发表时间：
1993-09-01
影响因子：
11.1
作者：
RASMUSSEN, EB;LIS, JT
通讯作者：
LIS, JT
影响因子：
64.5
作者：
Guenther, Matthew G.;Levine, Stuart S.;Young, Richard A.
通讯作者：
Young, Richard A.
影响因子：
30.8
作者：
Zeitlinger, Julia;Stark, Alexander;Young, Richard A.
通讯作者：
Young, Richard A.
影响因子：
4.8
作者：
Komissarova, N;Kashlev, M
通讯作者：
Kashlev, M