MolADI: A Web Server for Automatic Analysis of Protein-Small Molecule Dynamic Interactions.
MolADI: A Web Server for Automatic Analysis of Protein-Small Molecule Dynamic Interactions.
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MolADI：一个自动分析蛋白质-小分子动态相互作用的Web服务器。
DOI：
10.3390/molecules26154625
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发表时间：
2021-07-30
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Yuan S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bai B;Zou R;Chan HCS;Li H;Yuan S
蛋白质-配体相互作用分析对于药物发现和蛋白质合理设计具有重要意义。现有的在线工具仅采用复杂结构的单一构象来计算和显示相互作用，而蛋白质残基和配体分子都具有一定的灵活性。随着时间的推移，在轨迹的相互作用演变的更大的兴趣。MolADI是一个用户友好的在线工具，它可以详细分析蛋白质-配体相互作用的单一结构或轨迹。交互可以通过2D图形和3D表示轻松查看。MolADI是一个网络应用程序。
Protein–ligand interaction analysis is important for drug discovery and rational protein design. The existing online tools adopt only a single conformation of the complex structure for calculating and displaying the interactions, whereas both protein residues and ligand molecules are flexible to some extent. The interactions evolved with time in the trajectories are of greater interest. MolADI is a user-friendly online tool which analyzes the protein–ligand interactions in detail for either a single structure or a trajectory. Interactions can be viewed easily with both 2D graphs and 3D representations. MolADI is available as a web application.
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10.1107/s0108767307035623
发表时间：
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作者：
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通讯作者：
Berman, Helen M.