Solution structure of the Atg1 complex: implications for the architecture of the phagophore assembly site.
Solution structure of the Atg1 complex: implications for the architecture of the phagophore assembly site.
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DOI：
10.1016/j.str.2015.02.012
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发表时间：
2015-05-05
期刊：
影响因子：
5.7
通讯作者：
Hurley, James H.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Koefinger, Juergen;Ragusa, Michael J.;Lee, Il-Hyung;Hummer, Gerhard;Hurley, James H.
自噬体的生物发生始于噬菌体组装位点 (PAS)，这是一种由 Atg1 复合物组织的蛋白质囊泡超微结构。 Atg1 复合体由 Atg1 蛋白激酶、本质上无序区域丰富的 Atg13 和二聚体双新月形 Atg17-Atg31-Atg29 亚复合体组成。我们发现 PAS 含有相对均匀的约 28 个 Atg17 拷贝，并且在自噬诱导后，含有相似数量的 Atg1 和 Atg13 分子。然后，我们应用小角度 X 射线散射 (SAXS) 的系综细化来确定 Atg1-Atg13 和 Atg17-Atg31-Atg29 子复合物以及 Atg1 复合物的溶液结构，使用易于生物物理研究的修剪“迷你五聚体”。我们观察到 Atg1 五聚体的四聚体通过 Atg17-Atg31-Atg29 组装。这导致了 PAS 支架中 Atg1 复合物的更高组织的模型。
The biogenesis of autophagosomes commences at the phagophore assembly site (PAS), a protein-vesicle ultrastructure that is organized by the Atg1 complex. The Atg1 complex consists of the Atg1 protein kinase, the intrinsically disordered region-rich Atg13, and the dimeric double crescent-shaped Atg17-Atg31-Atg29 subcomplex. We show that the PAS contains a relatively uniform ~28 copies of Atg17, and upon autophagy induction, similar numbers of Atg1 and Atg13 molecules. We then apply ensemble refinement of small angle x-ray scattering (SAXS) to determine the solution structures of the Atg1-Atg13 and Atg17-Atg31-Atg29 subcomplexes and the Atg1 complex, using a trimmed “mini-pentamer” tractable to biophysical studies. We observe tetramers of Atg1 pentamers that assemble via Atg17-Atg31-Atg29. This leads to a model for the higher organization of the Atg1 complex in PAS scaffolding.
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