Cell cycle-dependent turnover of 5-hydroxymethyl cytosine in mouse embryonic stem cells.
Cell cycle-dependent turnover of 5-hydroxymethyl cytosine in mouse embryonic stem cells.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0082961
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发表时间：
2013
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Tajima S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Otani J;Kimura H;Sharif J;Endo TA;Mishima Y;Kawakami T;Koseki H;Shirakawa M;Suetake I;Tajima S
据报道，基因组中的羟甲基胞嘧啶是去甲基化的中间产物。在本研究中，我们证明维持甲基转移酶Dnmt1几乎不催化半羟甲基化DNA，并且半羟甲基化DNA不能被Uhrf1的SRA结构域选择性识别，这表明羟甲基胞嘧啶以复制依赖的方式被稀释。小鼠胚胎干细胞中高水平的5-羟甲基胞嘧啶主要由新生型DNA甲基转移酶Dnmt3a和Dnmt3b提供的甲基胞嘧啶产生。HoxA基因簇的启动子区显示高羟甲基化水平，而甲基胞嘧啶水平很低，表明甲基化的CpG在增殖过程中被积极羟化。所有结果表明，小鼠胚胎干细胞中羟甲基胞嘧啶的去除和产生以复制依赖的方式受到调节。
Hydroxymethylcytosine in the genome is reported to be an intermediate of demethylation. In the present study, we demonstrated that maintenance methyltransferase Dnmt1 scarcely catalyzed hemi-hydroxymethylated DNA and that the hemi-hydroxymethylated DNA was not selectively recognized by the SRA domain of Uhrf1, indicating that hydroxymethylcytosine is diluted in a replication-dependent manner. A high level of 5-hydroxymethylcytosine in mouse embryonic stem cells was produced from the methylcytosine supplied mainly by de novo-type DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b. The promoter regions of the HoxA gene cluster showed a high hydroxymethylation level whilst the methylcytosine level was quite low, suggesting that methylated CpG is actively hydroxylated during proliferation. All the results indicate that removal and production of hydroxymethylcytosine are regulated in replication-dependent manners in mouse embryonic stem cells.
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影响因子：
7.8
作者：
Jin, P;Hardy, S;Morgan, DO
通讯作者：
Morgan, DO
DOI：
10.1126/science.1229277
发表时间：
2013-01-25
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Hackett JA;Sengupta R;Zylicz JJ;Murakami K;Lee C;Down TA;Surani MA
通讯作者：
Surani MA
影响因子：
64.5
作者：
Okano, M;Bell, DW;Li, E
通讯作者：
Li, E
影响因子：
5.3
作者：
Kimura, H;Tada, M;Tada, T
通讯作者：
Tada, T
影响因子：
5.3
作者：
Jackson, M;Krassowska, A;Ramsahoye, B
通讯作者：
Ramsahoye, B