Allelic variation in class I HLA determines CD8(+) T cell repertoire shape and cross-reactive memory responses to SARS-CoV-2.
Allelic variation in class I HLA determines CD8(+) T cell repertoire shape and cross-reactive memory responses to SARS-CoV-2.
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DOI：
10.1126/sciimmunol.abk3070
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发表时间：
2022-01-21
影响因子：
24.8
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中科院分区：
文献类型：
--
作者：
通过HLA I类分子将抗原有效呈递给CD 8 + T细胞是消除病毒和产生长期免疫记忆所必需的。在这项研究中，我们应用了单细胞，多组学技术，以产生一个统一的体外表征的CD 8 + T细胞对SARS-CoV-2跨越4个主要的HLA I类等位基因的反应。我们发现HLA基因型决定了表位特异性、TCR α/β序列多样性和对已有SARS-CoV-2反应性记忆T细胞库的利用等关键特征。单细胞转录组学揭示了SARS-CoV-2反应性T细胞的功能多样性T细胞表型，与疾病阶段和表位特异性相关。我们的研究结果表明，HLA变异显着影响CD 8 + T细胞库的形状和利用SARS-CoV-2感染后的免疫回忆。我们对CD 8 + T细胞对SARS-CoV-2的反应进行了统一的表征，揭示了由HLA基因型形成的预先存在的反应性。
Effective presentation of antigens by HLA class I molecules to CD8+ T cells is required for viral elimination and generation of long-term immunological memory. In this study, we applied a single-cell, multi-omic technology to generate a unified ex vivo characterization of the CD8+ T cell response to SARS-CoV-2 across 4 major HLA class I alleles. We found that HLA genotype conditions key features of epitope specificity, TCR α/β sequence diversity, and the utilization of pre-existing SARS-CoV-2 reactive memory T cell pools. Single-cell transcriptomics revealed functionally diverse T cell phenotypes of SARS-CoV-2-reactive T cells, associated with both disease stage and epitope specificity. Our results show that HLA variations significantly influence the CD8+ T cell repertoire shape and utilization of immune recall upon SARS-CoV-2 infection. We perform a unified characterization of CD8+ T cell responses to SARS-CoV-2, revealing pre-existing reactivity shaped by HLA genotype.
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影响因子：
32.4
作者：
Ferretti AP;Kula T;Wang Y;Nguyen DMV;Weinheimer A;Dunlap GS;Xu Q;Nabilsi N;Perullo CR;Cristofaro AW;Whitton HJ;Virbasius A;Olivier KJ Jr;Buckner LR;Alistar AT;Whitman ED;Bertino SA;Chattopadhyay S;MacBeath G
通讯作者：
MacBeath G
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Galletti G;De Simone G;Mazza EMC;Puccio S;Mezzanotte C;Bi TM;Davydov AN;Metsger M;Scamardella E;Alvisi G;De Paoli F;Zanon V;Scarpa A;Camisa B;Colombo FS;Anselmo A;Peano C;Polletti S;Mavilio D;Gattinoni L;Boi SK;Youngblood BA;Jones RE;Baird DM;Gostick E;Llewellyn-Lacey S;Ladell K;Price DA;Chudakov DM;Newell EW;Casucci M;Lugli E
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Lugli E
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Addetia A;Crawford KHD;Dingens A;Zhu H;Roychoudhury P;Huang ML;Jerome KR;Bloom JD;Greninger AL
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Greninger AL
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