High-resolution Patterned Biofilm Deposition Using pDawn-Ag43.
High-resolution Patterned Biofilm Deposition Using pDawn-Ag43.
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DOI：
10.3791/58625
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发表时间：
2018-10-23
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Riedel-Kruse IH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jin X;Riedel-Kruse IH
空间结构和图案在细菌生物膜中起着重要作用。在这里，我们展示了一种以高空间分辨率将大肠杆菌生物膜培养成任意空间图案的可行方法。该技术使用基因编码的光遗传学结构——pDawn-Ag43——将大肠杆菌中生物膜的形成与蓝光的光刺激结合起来。我们详细介绍了使用 pDawn-Ag43 转化大肠杆菌的过程、准备所需的光学装置以及使用 pDawn-Ag43 细菌培养图案生物膜的方案。使用该协议，空间分辨率低于 25 μm 的生物膜可以在各种表面和环境（包括封闭室）上形成图案，而无需微加工、洁净室设施或表面预处理。该技术方便且适用于研究生物膜结构影响的应用，提供对生物膜图案的可调控制。更广泛地说，它在生物材料、教育和生物艺术方面也有潜在的应用。
Spatial structure and patterning play an important role in bacterial biofilms. Here we demonstrate an accessible method for culturing E. coli biofilms into arbitrary spatial patterns at high spatial resolution. The technique uses a genetically encoded optogenetic construct—pDawn-Ag43—that couples biofilm formation in E. coli to optical stimulation by blue light. We detail the process for transforming E. coli with pDawn-Ag43, preparing the required optical set-up, and the protocol for culturing patterned biofilms using pDawn-Ag43 bacteria. Using this protocol, biofilms with a spatial resolution below 25 μm can be patterned on various surfaces and environments, including enclosed chambers, without requiring microfabrication, clean-room facilities, or surface pretreatment. The technique is convenient and appropriate for use in applications that investigate the effect of biofilm structure, providing tunable control over biofilm patterning. More broadly, it also has potential applications in biomaterials, education, and bio-art.
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影响因子：
9.8
作者：
Cira NJ;Chung AM;Denisin AK;Rensi S;Sanchez GN;Quake SR;Riedel-Kruse IH
通讯作者：
Riedel-Kruse IH
影响因子：
4.4
作者：
Christensen, BB;Haagensen, JAJ;Molin, S
通讯作者：
Molin, S
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
5.6
作者：
Ohlendorf, Robert;Vidavski, Roee R.;Moeglich, Andreas
通讯作者：
Moeglich, Andreas
影响因子：
3.9
作者：
Gu, Huan;Hou, Shuyu;Ren, Dacheng
通讯作者：
Ren, Dacheng