Electrostatic interactions and hydrogen bond dynamics in chloride pumping by halorhodopsin.
Electrostatic interactions and hydrogen bond dynamics in chloride pumping by halorhodopsin.
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盐视紫红质泵送氯离子中的静电相互作用和氢键动力学。
DOI：
10.1016/j.bbabio.2014.09.006
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发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Tobias,DouglasJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jardón-Valadez,Eduardo;Bondar,Ana-Nicoleta;Tobias,DouglasJ
离子泵使带负电的离子穿过细胞膜的易位提出了蛋白质相互作用如何控制离子的位置和动力学的问题。在这里，我们通过对野生型和突变型盐视紫红质进行广泛的分子动力学模拟来解决这个问题，盐视紫红质是一种七螺旋跨膜蛋白，在光吸收时易位氯离子。我们发现，由关键精氨酸基团介导的螺旋间氢键在很大程度上控制着协调氯离子的蛋白质和水基团的动力学。
Translocation of negatively charged ions across cell membranes by ion pumps raises the question as to how protein interactions control the location and dynamics of the ion. Here we address this question by performing extensive molecular dynamics simulations of wild type and mutant halorhodopsin, a seven-helical transmembrane protein that translocates chloride ions upon light absorption. We find that inter-helical hydrogen bonds mediated by a key arginine group largely govern the dynamics of the protein and water groups coordinating the chloride ion.
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影响因子：
3.3
作者：
Klauda, Jeffery B.;Venable, Richard M.;Freites, J. Alfredo;O'Connor, Joseph W.;Tobias, Douglas J.;Mondragon-Ramirez, Carlos;Vorobyov, Igor;MacKerell, Alexander D., Jr.;Pastor, Richard W.
通讯作者：
Pastor, Richard W.
影响因子：
2.9
作者：
G. Varo;L. Brown;J. Sasaki;H. Kandori;A. Maeda;R. Needleman;J. Lanyi
通讯作者：
G. Varo;L. Brown;J. Sasaki;H. Kandori;A. Maeda;R. Needleman;J. Lanyi
盐视紫红质视网膜异构组成和平衡的傅里叶变换拉曼研究
影响因子：
3.3
作者：
L. Zimányi;J. Lanyi
通讯作者：
J. Lanyi
影响因子：
3.4
作者：
G. Varo;L. Zimányi;Xiaolei Fan;Li Sun;R. Needleman;J. Lanyi
通讯作者：
G. Varo;L. Zimányi;Xiaolei Fan;Li Sun;R. Needleman;J. Lanyi
影响因子：
3.4
作者：
Aksimentiev, A;Schulten, K
通讯作者：
Schulten, K