Chromatin states define tumour-specific T cell dysfunction and reprogramming.
Chromatin states define tumour-specific T cell dysfunction and reprogramming.
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DOI：
10.1038/nature22367
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发表时间：
2017-05-25
期刊：
影响因子：
64.8
通讯作者：
Schietinger A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Philip M;Fairchild L;Sun L;Horste EL;Camara S;Shakiba M;Scott AC;Viale A;Lauer P;Merghoub T;Hellmann MD;Wolchok JD;Leslie CS;Schietinger A
实体瘤中的肿瘤特异性CD8 T细胞功能失调，使肿瘤发展。T细胞功能障碍和治疗性重编程的表观遗传调控（例如，免疫检查点阻断）尚不清楚。在这里，我们展示了小鼠肿瘤中的T细胞通过两种离散的染色质状态进行分化：一种是可塑性功能失调状态，T细胞可以从中获救；另一种是固定功能失调状态，细胞对重编程有抵抗力。我们鉴定了与每一种染色质状态相关的表面标记，这些标记区分了肿瘤小鼠异质T细胞群中的可重编程和非可重编程PD1hi功能失调T细胞；这些表面标记物也在人PD1hi肿瘤浸润性CD8 T细胞上表达。我们的研究对癌症免疫治疗具有重要意义，因为我们定义了T细胞功能障碍的关键转录因子和表观遗传程序，以及预测治疗可重编程性的表面标记。
Tumour-specific CD8 T cells in solid tumours are dysfunctional, allowing tumours to progress. The epigenetic regulation of T cell dysfunction and therapeutic reprogrammability (for example, to immune checkpoint blockade) is not well understood. Here we show that T cells in mouse tumours differentiate through two discrete chromatin states: a plastic dysfunctional state from which T cells can be rescued, and a fixed dysfunctional state in which the cells are resistant to reprogramming. We identified surface markers associated with each chromatin state that distinguished reprogrammable from non-reprogrammable PD1hi dysfunctional T cells within heterogeneous T cell populations from tumours in mice; these surface markers were also expressed on human PD1hi tumour-infiltrating CD8 T cells. Our study has important implications for cancer immunotherapy as we define key transcription factors and epigenetic programs underlying T cell dysfunction and surface markers that predict therapeutic reprogrammability.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btr064
发表时间：
2011-04-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Grant CE;Bailey TL;Noble WS
通讯作者：
Noble WS
影响因子：
48
作者：
Langmead, Ben;Salzberg, Steven L.
通讯作者：
Salzberg, Steven L.
影响因子：
4.4
作者：
Li, Yufeng;Liu, Shujuan;Radvanyi, Laszlo
通讯作者：
Radvanyi, Laszlo
影响因子：
30.5
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
64.8
作者：
Cuylen S;Blaukopf C;Politi AZ;Müller-Reichert T;Neumann B;Poser I;Ellenberg J;Hyman AA;Gerlich DW
通讯作者：
Gerlich DW