A systematic comparative and structural analysis of protein phosphorylation sites based on the mtcPTM database.
A systematic comparative and structural analysis of protein phosphorylation sites based on the mtcPTM database.
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DOI：
10.1186/gb-2007-8-5-r90
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发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Durbin R
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jiménez JL;Hegemann B;Hutchins JR;Peters JM;Durbin R
mtcPTM 是一个新的磷酸化蛋白质序列和原子模型数据库。对 mtcPTM 中磷酸位点的分析表明，磷酸化位点存在于高度异质的结构和序列背景中。 mtcPTM 是人类和小鼠磷酸位点的在线存储库，其中数据按层次结构组织以保存生物学相关的实验信息，从而可以直接比较不同条件下发现的磷酸化模式。该数据库还包含最大的可用磷酸化蛋白质原子模型集合。对该结构数据集的详细分析表明，磷酸化位点存在于不同的结构和序列背景中。 mtcPTM 可在网上获取。
mtcPTM is a new database of phosphorylated protein sequences and atomic models. Analysis of the phosphosites in mtcPTM showed that phosphorylation sites are found in a highly heterogeneous range of structural and sequence contexts. mtcPTM is an online repository of human and mouse phosphosites in which data are hierarchically organized to preserve biologically relevant experimental information, thus allowing straightforward comparisons of phosphorylation patterns found under different conditions. The database also contains the largest available collection of atomic models of phosphorylatable proteins. Detailed analysis of this structural dataset reveals that phosphorylation sites are found in a heterogeneous range of structural and sequence contexts. mtcPTM is available on the web .
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