Global regulation of promoter melting in naive lymphocytes.
Global regulation of promoter melting in naive lymphocytes.
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DOI：
10.1016/j.cell.2013.04.033
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发表时间：
2013-05-23
期刊：
影响因子：
64.5
通讯作者：
Casellas R
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kouzine F;Wojtowicz D;Yamane A;Resch W;Kieffer-Kwon KR;Bandle R;Nelson S;Nakahashi H;Awasthi P;Feigenbaum L;Menoni H;Hoeijmakers J;Vermeulen W;Ge H;Przytycka TM;Levens D;Casellas R
淋巴细胞活化是由mRNA合成的整体增加启动的。然而，在免疫应答期间驱动转录组扩增的机制是未知的。通过监测ssDNA全基因组，我们表明幼稚细胞的基因组准备快速激活。在G 0，~90%的基因启动子在循环淋巴细胞中表达的聚合酶负载，但不熔化，只支持基础转录。此外，从败育延伸到生产性延伸的转变是动力学限制性的，导致聚合酶在更接近转录起始位点（TSS）处积累。静息淋巴细胞也限制TFIIH复合物的表达，包括参与启动子解链和开放复合物延伸的XPB和XPD解旋酶。到目前为止，两个限速步骤已被证明是控制全球基因表达的真核生物：preinitiation复合体组装和聚合酶暂停。我们的研究确定启动子熔化作为第三个关键的调节步骤，并提出这种机制，确保迅速淋巴细胞对入侵病原体的反应。
Lymphocyte activation is initiated by a global increase in mRNA synthesis. However, the mechanisms driving transcriptome amplification during the immune response are unknown. By monitoring ssDNA genome-wide, we show that the genome of naïve cells is poised for rapid activation. In G0, ~90% of promoters from genes to be expressed in cycling lymphocytes are polymerase-loaded but unmelted and support only basal transcription. Furthermore, the transition from abortive to productive elongation is kinetically limiting causing polymerases to accumulate nearer transcription start sites (TSSs). Resting lymphocytes also limit expression of the TFIIH complex, including XPB and XPD helicases involved in promoter melting and open complex extension. To date, two rate-limiting steps have been shown to control global gene expression in eukaryotes: preinitiation complex assembly and polymerase pausing. Our studies identify promoter melting as a third key regulatory step and propose that this mechanism ensures a prompt lymphocyte response to invading pathogens.
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影响因子：
5.3
作者：
GILMOUR, DS;LIS, JT
通讯作者：
LIS, JT
影响因子：
64.5
作者：
Barlow JH;Faryabi RB;Callén E;Wong N;Malhowski A;Chen HT;Gutierrez-Cruz G;Sun HW;McKinnon P;Wright G;Casellas R;Robbiani DF;Staudt L;Fernandez-Capetillo O;Nussenzweig A
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作者：
Guenther, Matthew G.;Levine, Stuart S.;Young, Richard A.
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作者：
GOODRICH, JA;TJIAN, R
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de Boer, J;de Wit, J;Weeda, G
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