Comparison of methods to quantify inducible HIV-1 outgrowth.
Comparison of methods to quantify inducible HIV-1 outgrowth.
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DOI：
10.1016/j.jve.2021.100043
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发表时间：
2021-06
影响因子：
5.5
通讯作者：
Sobolewski MD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Enick PN;Brooker JP;Tumiotto CM;Staines BT;Eron JJ;McMahon DK;Gandhi RT;Mellors JW;Sobolewski MD
定量病毒生长测定 (qVOA) 是测量可诱导、具有复制能力的 HIV-1 的金标准。已提出使用 MOLT4-R5 和 SupT1-R5 细胞系代替同种异体母细胞，并使用 HIV-1 RNA 检测而不是 p24 酶免疫测定 (EIA) 来提高 qVOA 的灵敏度。然而，目前尚不清楚这些替代方法如何影响 qVOA 性能。我们对 15 名接受抑制性抗逆转录病毒治疗的 HIV-1 患者的三种 qVOA 方法进行了比较，发现 MOLT4-R5 方法产生的 p24 阳性孔的比例 (42%) 显着高于同种异体原始细胞 (29%) 和 SupT1-R5 (32%) 测定。此外，p24 EIA 呈阴性的 7 个 qVOA 中有 5 个通过 HIV-1 RNA 定量显示病毒生长（7 天内增加>10 倍）。这些发现揭示了 qVOA 可能低估潜在的诱导型病毒库，具体取决于所使用的靶细胞和病毒生长的测量。使用 MOLT4-R5 细胞与 p24 EIA 和 HIV-1 RNA 检测病毒生长是最敏感的方法。
The quantitative viral outgrowth assay (qVOA) is the gold standard for measuring inducible, replication-competent HIV-1. Using MOLT4-R5 and SupT1-R5 cell lines instead of allogeneic blasts and HIV-1 RNA detection rather than p24 enzyme-immunoassay (EIA) has been proposed to improve the sensitivity of the qVOA. It is unclear, however, how these alternative approaches affect qVOA performance. We compared three qVOAs methods across 15 persons with HIV-1 on suppressive antiretroviral therapy and found that the MOLT4-R5 method yielded a significantly higher proportion of p24-positive wells (42%) than both the allogeneic blast (29%) and SupT1-R5 (32%) assays. Additionally, 5 of 7 qVOAs that were negative by p24 EIA showed viral outgrowth by HIV-1 RNA quantification (>10-fold increase within 7 days). These findings reveal the potential for underestimation of the latent, inducible reservoir by qVOA depending on the target cells used and the measure of viral outgrowth. Use of MOLT4-R5 cells with both p24 EIA and HIV-1 RNA to detect viral outgrowth was the most sensitive method.
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影响因子：
15.3
作者：
Gaebler, Christian;Lorenzi, Julio C. C.;Nussenzweig, Michel C.
通讯作者：
Nussenzweig, Michel C.
影响因子：
64.5
作者：
Ho YC;Shan L;Hosmane NN;Wang J;Laskey SB;Rosenbloom DI;Lai J;Blankson JN;Siliciano JD;Siliciano RF
通讯作者：
Siliciano RF
DOI：
10.1093/infdis/jiaa089
发表时间：
2021-10-13
期刊：
The Journal of infectious diseases
影响因子：
--
作者：
Stone M;Rosenbloom DIS;Bacchetti P;Deng X;Dimapasoc M;Keating S;Bakkour S;Richman DD;Mellors JW;Deeks SG;Lai J;Beg S;Siliciano JD;Pagliuzza A;Chomont N;Lackman-Smith C;Ptak RG;Busch MP
通讯作者：
Busch MP
影响因子：
4.2
作者：
Rosenbloom DI;Elliott O;Hill AL;Henrich TJ;Siliciano JM;Siliciano RF
通讯作者：
Siliciano RF
影响因子：
30.3
作者：
Hataye, Jason M.;Casazza, Joseph P.;Koup, Richard A.
通讯作者：
Koup, Richard A.