Lipidomics and Biomarker Discovery in Kidney Disease.
Lipidomics and Biomarker Discovery in Kidney Disease.
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DOI：
10.1016/j.semnephrol.2018.01.004
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发表时间：
2018-03
影响因子：
3.3
通讯作者：
Pennathur S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Afshinnia F;Rajendiran TM;Wernisch S;Soni T;Jadoon A;Karnovsky A;Michailidis G;Pennathur S
基于质谱的脂质组学平台的技术进步为生物样品中的脂质全面分析提供了机会，并揭示了代谢紊乱中脂质组的变化。脂质组学方法是发现生物标志物和深入了解疾病分子机制的有力工具，特别是当与其他组学平台（即转录组学、蛋白质组学和代谢组学）在系统生物学的背景下整合时。在这篇综述中，我们描述了通常应用于脂质组学研究的工作流程，包括研究设计、样品制备、生物标志物鉴定和定量、数据处理和分析的重要方面，以及临床应用中的关键考虑因素。我们还回顾了最近关于脂质组学平台应用的一些研究，这些研究突出了脂质生物标志物的潜力，并增加了我们对肾脏疾病分子基础的理解。
Technological advances in mass spectrometry-based lipidomic platforms have provided the opportunity for comprehensive profiling of lipids in biological samples and revealed alterations in the lipidome that occur in metabolic disorders. A lipidomic approach serves as a powerful tool for biomarker discovery and gaining insight to molecular mechanisms of disease especially when integrated with other – omics platforms, i.e. transcriptomics, proteomics, and metabolomics, in the context of systems biology. In this review, we describe the workflow commonly applied to the conduct of lipidomic studies including important aspects of study design, sample preparation, biomarker identification and quantification, and data processing and analysis, as well as crucial considerations in clinical applications. We also review some recent studies of the application of lipidomic platforms that highlight the potential of lipid biomarkers and add to our understanding of the molecular basis of kidney disease.
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DOI：
10.1016/j.jchromb.2008.12.057
发表时间：
2009-09-15
期刊：
Journal of chromatography. B, Analytical technologies in the biomedical and life sciences
影响因子：
--
作者：
Haynes CA;Allegood JC;Park H;Sullards MC
通讯作者：
Sullards MC
影响因子：
6
作者：
Afshinnia F;Rajendiran TM;Karnovsky A;Soni T;Wang X;Xie D;Yang W;Shafi T;Weir MR;He J;Brecklin CS;Rhee EP;Schelling JR;Ojo A;Feldman H;Michailidis G;Pennathur S
通讯作者：
Pennathur S
DOI：
10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x
发表时间：
1995-01-01
影响因子：
5.8
作者：
BENJAMINI, Y;HOCHBERG, Y
通讯作者：
HOCHBERG, Y
影响因子：
13.6
作者：
Afshinnia, Farsad;Rajendiran, Thekkelnaycke M.;Pennathur, Subramaniam
通讯作者：
Pennathur, Subramaniam
影响因子：
4.3
作者：
Fenn, Larissa S.;Kliman, Michal;Mahsut, Ablatt;Zhao, Sophie R.;McLean, John A.
通讯作者：
McLean, John A.