FluxNorm: Toolbox for metabolic flux assay normalization by in situ cell counting.
FluxNorm: Toolbox for metabolic flux assay normalization by in situ cell counting.
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FluxNorm：通过原位细胞计数进行代谢通量测定标准化的工具箱。
DOI：
10.1101/2023.10.13.562314
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发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Pekkurnaz,Gulcin
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Djaja,NathalieA;Bracha,Teva;Yu,SeungyoonB;Wang,Haoming;Carlson,NatashaM;Pekkurnaz,Gulcin
基于平板的定量代谢通量分析已成为检测细胞代谢和线粒体生物能量学的核心技术。然而，在多孔微孔板中准确解释不同实验条件下的代谢活性需要基于原位细胞计数的数据归一化。在这里，我们描述了FluxNorm，一个独立于平台的半自动计算工作流程，对三种不同的细胞类型进行了验证，以标准化细胞密度以准确评估细胞生物能量学。
Plate-based quantitative metabolic flux analysis has emerged as the central technology to examine cellular metabolism and mitochondrial bioenergetics. However, accurate interpretation of metabolic activity between different experimental conditions in multi-well microplates requires data normalization based on in situ cell counts. Here, we describe FluxNorm, a platform-independent semi-automated computational workflow, validated for three different cell types, to normalize cell density for accurate assessment of cellular bioenergetics.
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