The environment ontology: contextualising biological and biomedical entities.
The environment ontology: contextualising biological and biomedical entities.
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DOI：
10.1186/2041-1480-4-43
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发表时间：
2013-12-11
影响因子：
1.9
通讯作者：
ENVO Consortium
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Buttigieg PL;Morrison N;Smith B;Mungall CJ;Lewis SE;ENVO Consortium
随着生物和生物医学研究越来越多地参考所研究的生物实体的环境背景，对环境描述符的形式化和标准化的需求也在增长。环境本体（ENVO; http://www.environmentontology.org）是一个社区主导的开放项目，旨在提供一个本体，用于指定与多个生命科学学科相关的广泛环境，并通过开放参与模型，以适应所有需要使用本体类注释数据的术语要求。本文总结了ENVO的动机，内容，结构，采用和治理方法。本体可从http://purl.obolibrary.org/obo/envo.owl获得-OBO格式版本也可通过将文件后缀切换为“obo”获得。
As biological and biomedical research increasingly reference the environmental context of the biological entities under study, the need for formalisation and standardisation of environment descriptors is growing. The Environment Ontology (ENVO; http://www.environmentontology.org) is a community-led, open project which seeks to provide an ontology for specifying a wide range of environments relevant to multiple life science disciplines and, through an open participation model, to accommodate the terminological requirements of all those needing to annotate data using ontology classes. This paper summarises ENVO’s motivation, content, structure, adoption, and governance approach. The ontology is available from http://purl.obolibrary.org/obo/envo.owl - an OBO format version is also available by switching the file suffix to “obo”.
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DOI：
10.1073/pnas.0905137106
发表时间：
2009-11-17
影响因子：
11.1
作者：
Holt, Robert D.
通讯作者：
Holt, Robert D.
影响因子：
10.4
作者：
Eisenberg, Joseph N. S.;Desai, Manish A.;Scott, James C.
通讯作者：
Scott, James C.
影响因子：
5.1
作者：
Flemons, Paul;Guralnick, Robert;Neufeld, David
通讯作者：
Neufeld, David
影响因子：
--
作者：
Laforest BJ;Winegardner AK;Zaheer OA;Jeffery NW;Boyle EE;Adamowicz SJ
通讯作者：
Adamowicz SJ
影响因子：
7
作者：
Chaffron, Samuel;Rehrauer, Hubert;von Mering, Christian
通讯作者：
von Mering, Christian