ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics.
ACME dissociation: a versatile cell fixation-dissociation method for single-cell transcriptomics.
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DOI：
10.1186/s13059-021-02302-5
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发表时间：
2021-04-08
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Solana J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
García-Castro H;Kenny NJ;Iglesias M;Álvarez-Campos P;Mason V;Elek A;Schönauer A;Sleight VA;Neiro J;Aboobaker A;Permanyer J;Irimia M;Sebé-Pedrós A;Solana J
单细胞测序技术正在彻底改变生物学，但它们受到需要解离活样品的限制。在这里，我们提出了ACME（醋酸-甲醇），一种同时固定细胞的单细胞转录组学解离方法。ACME解离的细胞具有高RNA完整性，可以多次冷冻保存，并且是可分选的和可渗透的。作为原理的证明，我们使用基于液滴和组合条形码单细胞方法提供不同物种的单细胞转录组数据。ACME使用价格实惠的试剂，可以在大多数实验室甚至在现场完成，因此将加速我们对生命之树中细胞类型的了解。在线版本包含补充材料，可通过10.1186/s13059-021-02302-5获得。
Single-cell sequencing technologies are revolutionizing biology, but they are limited by the need to dissociate live samples. Here, we present ACME (ACetic-MEthanol), a dissociation approach for single-cell transcriptomics that simultaneously fixes cells. ACME-dissociated cells have high RNA integrity, can be cryopreserved multiple times, and are sortable and permeable. As a proof of principle, we provide single-cell transcriptomic data of different species, using both droplet-based and combinatorial barcoding single-cell methods. ACME uses affordable reagents, can be done in most laboratories and even in the field, and thus will accelerate our knowledge of cell types across the tree of life. The online version contains supplementary material available at 10.1186/s13059-021-02302-5.
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影响因子：
64.8
作者：
Cao, Junyue;Spielmann, Malte;Shendure, Jay
通讯作者：
Shendure, Jay
影响因子：
5.8
作者：
Gu, Zuguang;Eils, Roland;Schlesner, Matthias
通讯作者：
Schlesner, Matthias
影响因子：
5.4
作者：
Alles J;Karaiskos N;Praktiknjo SD;Grosswendt S;Wahle P;Ruffault PL;Ayoub S;Schreyer L;Boltengagen A;Birchmeier C;Zinzen R;Kocks C;Rajewsky N
通讯作者：
Rajewsky N
DOI：
10.1007/bf00577724
发表时间：
1973-01-01
影响因子：
--
作者：
DAVID, CN
通讯作者：
DAVID, CN
影响因子：
64.5
作者：
Davie K;Janssens J;Koldere D;De Waegeneer M;Pech U;Kreft Ł;Aibar S;Makhzami S;Christiaens V;Bravo González-Blas C;Poovathingal S;Hulselmans G;Spanier KI;Moerman T;Vanspauwen B;Geurs S;Voet T;Lammertyn J;Thienpont B;Liu S;Konstantinides N;Fiers M;Verstreken P;Aerts S
通讯作者：
Aerts S