Next-generation sequencing yields the complete mitochondrial genome of Corydoras sterbai (Teleostei, Siluriformes, Callichthyidae, Corydoradinae).
Next-generation sequencing yields the complete mitochondrial genome of Corydoras sterbai (Teleostei, Siluriformes, Callichthyidae, Corydoradinae).
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DOI：
10.1080/23802359.2019.1660255
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发表时间：
2019-09-06
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Xiao T
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Liu Q;Liu Y;Xu B;Xiao T
在这项工作中，我们报告了完整的线粒体基因组产生的下一代测序的斯氏兵鲶。线粒体基因组全长16，636 bp，碱基组成为32.70%A、26.40%T、26.00%C和14.90%G。它包含两个核糖体RNA基因，13个蛋白质编码基因，22个转运RNA基因和一个主要的非编码控制区（D环区）。这些基因的排列与在鲶形目中发现的相同。所有的蛋白质起始密码子都是ATG，除了cox 1以GTG开始。使用Geneious构建的邻居连接树表明，C。sterbai与Corydoras属的其它种聚在一起。说明其外部形态特征分类与分子分类结果一致。
In this work, we reported the complete mitochondrial genome yielded from next-generation sequencing of Corydoras sterbai. The total length of the mitochondrial genome is 16,636 bp, with the base composition of 32.70% A, 26.40% T, 26.00% C, and 14.90% G. It contains two ribosomal RNA genes, 13 protein-coding genes, 22 transfer RNA genes, and a major non-coding control region (D-loop region). The arrangement of these genes is the same as that found in the Siluriformes. All the protein initiation codons are ATG, except for cox1 that begins with GTG. The Neighbour-Joining tree built using Geneious showed that C. sterbai was clustered with other species from the genus Corydoras. It means that its external morphological feature classification is consistent with the molecular classification results.
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