Structural basis for the specialization of Nur, a nickel-specific Fur homolog, in metal sensing and DNA recognition.
Structural basis for the specialization of Nur, a nickel-specific Fur homolog, in metal sensing and DNA recognition.
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在金属传感和DNA识别中，NUR（镍特异性的皮毛同源物）NUR专业化的结构基础。
DOI：
10.1093/nar/gkp198
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发表时间：
2009-06
影响因子：
14.9
通讯作者：
Cha SS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
An YJ;Ahn BE;Han AR;Kim HM;Chung KM;Shin JH;Cho YB;Roe JH;Cha SS
Nur 是 Fur 家族的成员，是一种镍反应性转录因子，可控制天蓝色链霉菌中的镍稳态和抗氧化反应。在这里，我们报告了 Nur 的 2.4-Å 分辨率晶体结构。除了非特异性常见金属位点之外，它还包含独特的镍特异性金属位点。 Nur 识别盒的 6-5-6 基序和 Nur/DNA 复合物模型的鉴定表明，Nur 主要与回文结构的末端碱基相互作用形成复合物。这与 Fur 和 n-1-n 型 Fur 结合基序之间更分布的接触形成对比。 Nur 和 Fur 在 DNA 结合域中 S1-S2 片构象上的差异可以解释它们不同的 DNA 识别模式。此外，Nur 在金属传感和 DNA 识别中的特异性是由特定金属位点赋予的，这一事实表明它的引入推动了 Fur 家族中 Nur 直系同源物的进化。
Nur, a member of the Fur family, is a nickel-responsive transcription factor that controls nickel homeostasis and anti-oxidative response in Streptomyces coelicolor. Here we report the 2.4-Å resolution crystal structure of Nur. It contains a unique nickel-specific metal site in addition to a nonspecific common metal site. The identification of the 6-5-6 motif of the Nur recognition box and a Nur/DNA complex model reveals that Nur mainly interacts with terminal bases of the palindrome on complex formation. This contrasts with more distributed contacts between Fur and the n-1-n type of the Fur-binding motif. The disparity between Nur and Fur in the conformation of the S1-S2 sheet in the DNA-binding domain can explain their different DNA-recognition patterns. Furthermore, the fact that the specificity of Nur in metal sensing and DNA recognition is conferred by the specific metal site suggests that its introduction drives the evolution of Nur orthologs in the Fur family.
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影响因子：
14.9
作者：
Chen Z;Lewis KA;Shultzaberger RK;Lyakhov IG;Zheng M;Doan B;Storz G;Schneider TD
通讯作者：
Schneider TD
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作者：
Rodionov, DA;Hebbeln, P;Eitinger, T
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Kim, EJ;Chung, HJ;Roe, JH
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Fuangthong, M;Helmann, JD
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