High resolution single particle Cryo-EM refinement using JSPR.
High resolution single particle Cryo-EM refinement using JSPR.
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使用JSPR的高分辨率单粒子Cryo-EM精修。
DOI：
10.1016/j.pbiomolbio.2020.05.006
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发表时间：
2021-03
影响因子：
3.8
通讯作者：
Jiang W
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Sun C;Gonzalez B;Vago FS;Jiang W
JSPR是普渡大学江实验室开发的单粒子低温电磁图像处理和3D重建软件。它最初只是几个用于对称和不对称重建二十面体病毒的细化脚本，但已经发展成为一套全面的工具，用于构建从头重建、高分辨率细化病毒、包括螺旋管/细丝在内的任意对称的蛋白质复合体，以及图像文件处理实用程序。在这篇综述中，我们将提供使用JSPR实现的示例，并演示JSPR最近实现的功能，例如多像差“对齐”和使用“真”FSC评估地图分辨率的掩模自动优化。
JSPR is a single particle cryo-EM image processing and 3D reconstruction software developed in the Jiang laboratory at Purdue University. It began as a few refinement scripts for symmetric and asymmetric reconstructions of icosahedral viruses, but has grown into a comprehensive suite of tools for building ab initio reconstructions, high resolution refinements of viruses, protein complexes of arbitrary symmetries including helical tubes/filaments, and image file handling utilities. In this review, we will present examples achieved using JSPR and demonstrate recently implemented features of JSPR such as multi-aberration “alignments” and automatic optimization of masking for the assessment of map resolution using “true” FSC.
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DOI：
10.1073/pnas.1215563110
发表时间：
2013-04-23
影响因子：
11.1
作者：
Guo, Fei;Liu, Zheng;Jiang, Wen
通讯作者：
Jiang, Wen
DOI：
10.1073/pnas.1707369114
发表时间：
2017-07-25
影响因子：
11.1
作者：
Dong, Yangchao;Liu, Yue;Rossmann, Michael G.
通讯作者：
Rossmann, Michael G.
迭代螺旋实空间重构法： 解决实际聚合物带来的问题
影响因子：
3
作者：
Egelman, Edward H.
通讯作者：
Egelman, Edward H.
DOI：
10.1016/j.ymeth.2016.02.007
发表时间：
2016-05-01
期刊：
Methods (San Diego, Calif.)
影响因子：
--
作者：
Frank J;Ourmazd A
通讯作者：
Ourmazd A
影响因子：
8
作者：
Fischer, H;Polikarpov, I;Craievich, AF
通讯作者：
Craievich, AF